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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004243`

染色体: Chr02 坐标: 64620564-64621813 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004243`
名称	SmilChr02G004243
描述	uncharacterized SmilChr02G004243
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64620564 - 64621813 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009888`
GeneID	`131009888`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009888`
原始查询	`SmilChr02G004243`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=32.8; qcov=0.533; evalue=2.19e-21; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=30.1; qcov=0.783; evalue=5.49e-38; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009888

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793273.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057793273.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057793273.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793273.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793273.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64620563`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	42	A13,A15,A20,B101,B108,B109,B115,B117,B126,B131,B136,B140,B20,B21,B22,B29,B36,B43,B44,B45,B54,B57,B59,B60,B68,B81,B82,B84,B97,B98,C20,C3,C5,C50,C51,C6,C71,C80,C82,C83,D1,D10
`Chr2:64620582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C25
`Chr2:64620583`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	42	A13,A15,A20,A9,B101,B108,B109,B115,B117,B131,B136,B20,B21,B22,B29,B37,B44,B45,B54,B57,B59,B68,B81,B82,B84,B87,B97,C20,C3,C32,C48,C5,C50,C51,C56,C6,C69,C80,C82,C83,D10,D4
`Chr2:64620587`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	43	A13,A15,A20,A9,B101,B108,B109,B115,B117,B13,B131,B136,B20,B21,B22,B29,B37,B44,B45,B54,B57,B58,B59,B68,B81,B82,B84,B97,C20,C3,C32,C48,C5,C50,C51,C56,C6,C69,C80,C82,C83,D10,D4
`Chr2:64620588`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	B139,B43,B5,B88,C29,C38,C47,C58,C77
`Chr2:64620618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr2:64620623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B29,C48
`Chr2:64620631`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B136,B20,C51,C80
`Chr2:64620631`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B136,B20,C51,C80
`Chr2:64620656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:64620661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B68
`Chr2:64620690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793273.1

360 aa

180

360

RVT_1

PF00078 RVT_1 186-302 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793273.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	186	302	1.6e-18	68.0	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937290.1
ATGGGGCTGGAGGAAGATGAAATTATCAAGAGGAATGAGGCAACGACTAAAATGATCATTCAAATGAAGAATAGAGACAGTCTCCTTATCCAAAAATCAAGATCTCGGTGGCTGAAAGACGGGGATGTCAATAGCGGATTCTTTCACAAGGTGATTAACGGCAGAAGACTCAAGAATGAGATTTCAGGTCTCAGTGTGAAAGATAGTTGGATCGAAAAGCCCAAAGAAGTCAAAAGAGAGGTCAAAGCTCATTTTGAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009888
ATGGGGCTGGAGGAAGATGAAATTATCAAGAGGAATGAGGCAACGACTAAAATGATCATTCAAATGAAGAATAGAGACAGTCTCCTTATCCAAAAATCAAGATCTCGGTGGCTGAAAGACGGGGATGTCAATAGCGGATTCTTTCACAAGGTGATTAACGGCAGAAGACTCAAGAATGAGATTTCAGGTCTCAGTGTGAAAGATAGTTGGATCGAAAAGCCCAAAGAAGTCAAAAGAGAGGTCAAAGCTCATTTTGAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793273.1
MGLEEDEIIKRNEATTKMIIQMKNRDSLLIQKSRSRWLKDGDVNSGFFHKVINGRRLKNEISGLSVKDSWIEKPKEVKREVKAHFEAQFRERSRVRPLLPEDFVHKKIPDNTREWLDIPFTEDEIKTAVWNCEGGKSPGPDGFNFNFMKKCWGIIKGDLLEVMKEFHAHGKLARGYNPPFIALISKKEDASELKEFRPISLINCLYKAISKVLASKLKQVMHLLISECQSAFVEGRYILDGVIVLNKIIEEAKRRKKGIT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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