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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004246`

染色体: Chr02 坐标: 64655718-64657732 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004246`
名称	SmilChr02G004246
描述	probable ribosome biogenesis protein RLP24
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64655718 - 64657732 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013018`
GeneID	`131013018`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013018`
原始查询	`SmilChr02G004246`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable ribosome biogenesis protein RLP24
产物	probable ribosome biogenesis protein RLP24
Arabidopsis	`AT2G44860` (AT2G44860) Ribosomal protein L24e family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819095] identity=68.3; qcov=1.01; evalue=8.11e-78; confidence=high
Rice	`Os07g0292800` (P0656C04.124) - identity=68.7; qcov=1; evalue=4.76e-79; confidence=high
GO	GO:0005730 (nucleolus); GO:0042273 (ribosomal large subunit biogenesis)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01246 (Ribosomal_L24e)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013018

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057797001.1`
2	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057797001.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057797001.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797001.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797001.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64656929`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A25,B20,B29,B79,C58
`Chr2:64656929`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A25,B20,B29,B79,C58
`Chr2:64656969`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A25,B20,C58
`Chr2:64656969`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A25,B20,C58
`Chr2:64656978`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A25,B20,C58
`Chr2:64656978`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A25,B20,C58
`Chr2:64656982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:64657122`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B69,C26,C4,C5
`Chr2:64657334`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr2:64657439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:64657466`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:64657499`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B140,B36,B46,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797001.1

166 aa

166

Ribosomal_L24e

PF01246 Ribosomal_L24e 1-65 aa

XP_057797002.1

166 aa

166

Ribosomal_L24e

PF01246 Ribosomal_L24e 1-65 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797001.1`	Pfam	`PF01246`	Ribosomal_L24e	Domain	1	65	1.4e-34	118.8	Ribosomal protein L24e
`XP_057797002.1`	Pfam	`PF01246`	Ribosomal_L24e	Domain	1	65	1.4e-34	118.8	Ribosomal protein L24e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941019.1
TTTAGGAGATTATCAATTTATAATAGTGATGGAACTTTTGAAATTTTATTATCTTATTCATTTATCAAAATTATTAACTTAATGGGCCTATTACTTTATAAAAAAAAATCCATCGAGTATTACATAAGGAATTTTTACTGTATCCTAATAAACTCTTGTTTTAACCTTTTTAAAAGTCGTAAAACTAGAATCCTCTAGTCTCGCTTTAACCTCTCTTCCGTCTTCAGTTTCCTCCCCTCTCAATGCCCGCCATTGAAGTG...

XM_057941018.1
AATGCCCGCCATTGAAGGTTAACTTCTCTGTTTTTCTGACTCCGAGTTTTCAACTCGTTTTTCGGCTTCGGAGAATTAATACTCCAATTCTTTGCTCAATGGGGATTTTTAGAGCAGGGCAAATATGAGGTTGGAAAAATGCTGGTTCTGTTCTTCTACCATATATCCGGGCCATGGGATTCAATATGTTCGTAATGATGCAAAGATCTTTAGATTTTGTCGATCAAAATGCCATAAGAACTTCAAAATGAAGAGAAATC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131013018
ATGAGGTTGGAAAAATGCTGGTTCTGTTCTTCTACCATATATCCGGGCCATGGGATTCAATATGTTCGTAATGATGCAAAGATCTTTAGATTTTGTCGATCAAAATGCCATAAGAACTTCAAAATGAAGAGAAATCCTCGCAAAGTAAAATGGACTAAGGCTTATAGACGGTTGCATGGGAAGGACATGACACAGGACTCTACGTTTGACTTTGAAAGGAAGCGGAATAGACCTGAGAGATATGATAGGAATGTGACGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057797001.1
MRLEKCWFCSSTIYPGHGIQYVRNDAKIFRFCRSKCHKNFKMKRNPRKVKWTKAYRRLHGKDMTQDSTFDFERKRNRPERYDRNVTENTLKAIKKIDKVRVDRENRHHIKRMKPKKAQLQRELVKELEQSISMIRAPAPLQRDPSLTLPIKVKVSKPETQENRMEE

XP_057797002.1
MRLEKCWFCSSTIYPGHGIQYVRNDAKIFRFCRSKCHKNFKMKRNPRKVKWTKAYRRLHGKDMTQDSTFDFERKRNRPERYDRNVTENTLKAIKKIDKVRVDRENRHHIKRMKPKKAQLQRELVKELEQSISMIRAPAPLQRDPSLTLPIKVKVSKPETQENRMEE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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