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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004248`

染色体: Chr02 坐标: 64661246-64667099 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004248`
名称	SmilChr02G004248
描述	high mobility group B protein 9
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64661246 - 64667099 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013008`
GeneID	`131013008`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013008`
原始查询	`SmilChr02G004248`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	high mobility group B protein 9
产物	high mobility group B protein 9
Arabidopsis	`AT1G76110` (AT1G76110) HMG (high mobility group) box protein with ARID/BRIGHT DNA-binding domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843943] identity=56.2; qcov=1.1; evalue=7.84e-109; confidence=high
Rice	`Os02g0469900` (OsARID1) - identity=35.4; qcov=1.09; evalue=3.24e-61; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00505 (HMG_box); PF01388 (ARID); PF09011 (HMG_box_2); PF27637 (MNM1_beta)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013008

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796993.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796993.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796993.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796993.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057796993.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64661541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr2:64662022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr2:64666336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B57,B69,B9,C67
`Chr2:64666366`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C39
`Chr2:64666534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B69,C26,C4,C5
`Chr2:64666716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C75,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796993.1

285 aa

142

285

ARID

MNM1_beta

HMG_box_2

HMG_box

PF01388 ARID 26-110 aa PF27637 MNM1_beta 134-164 aa PF09011 HMG_box_2 200-269 aa PF00505 HMG_box 203-270 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796993.1`	Pfam	`PF01388`	ARID	Domain	26	110	1.5e-20	74.2	ARID/BRIGHT DNA binding domain
`XP_057796993.1`	Pfam	`PF27637`	MNM1_beta	Domain	134	164	7.5e-10	38.9	Metabolic network modulator 1 small beta sheet domain
`XP_057796993.1`	Pfam	`PF09011`	HMG_box_2	Domain	200	269	1.2e-10	42.6	HMG-box domain
`XP_057796993.1`	Pfam	`PF00505`	HMG_box	Domain	203	270	5.6e-11	43.4	HMG (high mobility group) box

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941010.1
GTATTGTTAGATGATTTTTTTTTATAAAAAAATAAATAAAAGAGTTGAAAAAGAGCATTGAGAAGTGAGGAGGGATTAATTTGGGTTGGTAAGTAAATGCCAAAATGGGAGTGGAAAATGCAATAACGCTTCTCACACGCGTAGCCAATCCCTGCTCCTTAAGCTTTTGCTCAGACTTCACCTCCCTTAATTACGAGCTTATCTTTGGAATCATCTCTCACTTTTCCACTTTTTAACACCAAATTTTTGTTTTGTCACTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013008
ATGTCGCCGGAAAAACTCAGAAATGGTGGCGAGATCCCCATCCCCCTAGCCTCCCACGACGACGTCGTCAAGGATCGAACCCTCTTCTTCAACACCCTCAGAAGCTTCCATTTTGCTCTCGCCTCCAAATTTCTGATTCCTGTGATCGGAGGGAAGGAGCTCAATCTGCATGTGCTCTATGTTGAAGTTACCAGAAGAGGCGGCTACGACAAGGTGGTGGCGGAAAAAAAATGGAGAGAGATAAGCGCAGTGTTCGATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796993.1
MSPEKLRNGGEIPIPLASHDDVVKDRTLFFNTLRSFHFALASKFLIPVIGGKELNLHVLYVEVTRRGGYDKVVAEKKWREISAVFDLSPTTTSASYALRKHYFTLLHRYEQVYFFRTQPALLNHTGPPSFHAVGTINAKFDCGYLISVKLGNETLNGVLYHPGNPGGAATAPPTCTALVPYTPVLHQPGRRTRRRRLGDPGRPKPNRSGYNFFFAEKHSALKSLYPNREREFTKMIGESWNKLSPEERVVYQNYGLKDKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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