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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004263`

染色体: Chr02 坐标: 64828012-64833569 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004263`
名称	SmilChr02G004263
描述	L-ascorbate oxidase homolog
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64828012 - 64833569 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012993`
GeneID	`131012993`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012993`
原始查询	`SmilChr02G004263`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	L-ascorbate oxidase homolog
产物	L-ascorbate oxidase homolog
Arabidopsis	`AT1G41830` (SKS6) SKU5-similar 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840792] identity=76.9; qcov=0.908; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0678800` - identity=65.8; qcov=0.888; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005507 (copper ion binding); GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00394 (Cu-oxidase); PF07731 (Cu-oxidase_2); PF07732 (Cu-oxidase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012993

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057796975.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796975.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796975.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796975.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796975.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64828174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:64828195`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:64828351`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B49
`Chr2:64828351`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B49
`Chr2:64828421`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A24,B35,B71,B91,C57
`Chr2:64828421`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A24,B35,B71,B91,C57
`Chr2:64828442`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B71
`Chr2:64828442`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B71
`Chr2:64828446`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B71
`Chr2:64828446`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B71
`Chr2:64828665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr2:64828784`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B127,B129,B54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796975.1

587 aa

294

587

Cu-oxidase_3

Cu-oxidase

Cu-oxidase_2

PF07732 Cu-oxidase_3 78-192 aa PF00394 Cu-oxidase 205-341 aa PF07731 Cu-oxidase_2 422-558 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796975.1`	Pfam	`PF07732`	Cu-oxidase_3	Domain	78	192	1.3e-38	132.4	Multicopper oxidase
`XP_057796975.1`	Pfam	`PF00394`	Cu-oxidase	Domain	205	341	9.8e-46	156.4	Multicopper oxidase
`XP_057796975.1`	Pfam	`PF07731`	Cu-oxidase_2	Domain	422	558	4e-33	114.8	Multicopper oxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940992.1
AAAATGCCAGAACTCTTAATGTCTTTTGTTGAGTAAAACAGTGTGGAAACAGAGTAATCAATATTTGAAAAACACCCCCATTACATGCTAATCATTTCATATGCTCCATTTTGTTGACTTCTAATTACTTCCCTCTATAATTCATTTCAATTTTCCCAAATCTAATTTCCCTCTCCCCTTTTACAAATCACAGACAGCCACAAAGTCTGTTGATCACAAACAAATTGACTTTCTTTTTTGTTTTCCTTATTTATTTATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012993
ATGCGATTGGGCCTTTCATTCACTTTACTCTTTAAAACCATTCTTCTAACTACCCACCACCTTCACTCACATTACATATCATCACCAAAAAACATAAAACTCCAAAACAACAACAGATTTTCTTCACATTCTTCCTCCACCACAATGCCATCGCCGCCGCTGAGACTAGCGGTTCTGTTCCTGTGCTTGGCCGCCGCCGCCGCCGACAGCCCCTACAGATTCTTCTCATGGAACGTCACTTACGGCACCATCTCTCCTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796975.1
MRLGLSFTLLFKTILLTTHHLHSHYISSPKNIKLQNNNRFSSHSSSTTMPSPPLRLAVLFLCLAAAAADSPYRFFSWNVTYGTISPLGVPQQGILINGQFPGPEIYSVTNDNIIVNVFNSLKEPFLIHWNGVQNRRNSYVDGVLGTTCPIPPGQNFTYILQMKDQIGSFFYFPSLAMHKAAGGFGGIRIMSRPLIPVPFDPPADDFTLLIGDWYKTNHTILKTILDRGKKLPFPHGVLINGRGPSATAFTVNQGKTYRLR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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