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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004267`

染色体: Chr02 坐标: 64885815-64886872 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004267`
名称	SmilChr02G004267
描述	uncharacterized SmilChr02G004267
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64885815 - 64886872 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013009`
GeneID	`131013009`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013009`
原始查询	`SmilChr02G004267`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT4G35690; symbol=AT4G35690; hit=AT4G35690; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	AT4G35690; symbol=AT4G35690; hit=AT4G35690; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G35690` (AT4G35690) - identity=35.1; qcov=1.04; evalue=5.08e-35; confidence=medium
Rice	`Os11g0160000` - identity=30.9; qcov=1.01; evalue=2.83e-22; confidence=low
GO	GO:0048364 (root development); GO:0048367 (shoot system development)
KEGG	-
Pfam	PF03087 (BPS1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013009

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796994.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057796994.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057796994.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796994.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796994.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64885929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr2:64886027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B103,B127,B129,B54
`Chr2:64886232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:64886233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr2:64886332`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B115,C45
`Chr2:64886454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:64886491`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796994.1

272 aa

136

272

BPS1

PF03087 BPS1 45-268 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796994.1`	Pfam	`PF03087`	BPS1	Family	45	268	2.3e-58	198.5	Protein BPS1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941011.1
CAGCAATTCCTGCCTCAAAATTAAATCCGTGCATGTCCCTATATATACAACTCTCCGTTTCCAAACTTTTTCAACATCTCAAAATCATCAATCCAATCCAAGGCATTTTCTCTCTAGAAGAAGATAAAAAAGATCAACAATGGCGTTCACACAAACACATTTCAGATCAATCAGTCTGCCTTCAAGACTAGATCAAGTGAGCTCAAAGAGTTTGGAATCGGAGTTGGAGAAATTGAAATGTGGATCTGGTAGCTCAGAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013009
ATGGCGTTCACACAAACACATTTCAGATCAATCAGTCTGCCTTCAAGACTAGATCAAGTGAGCTCAAAGAGTTTGGAATCGGAGTTGGAGAAATTGAAATGTGGATCTGGTAGCTCAGAGTCGGTTCAATCTGGACTCGTGGCGCTTGCACAACTCTACAATTCCGTTGAAGAATTCACTCAGAAATCAGCATTTCATCATCAAGATGAGAAATCGATGGAGGAATCTCTCTCGCAGTCGGTCGATCTGCTTGACGCGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796994.1
MAFTQTHFRSISLPSRLDQVSSKSLESELEKLKCGSGSSESVQSGLVALAQLYNSVEEFTQKSAFHHQDEKSMEESLSQSVDLLDACSAIREVLQMMRENVHALQSAMRRKGTDSSVQNDVAAYFSLRKKMQKTVAKTLKNLKKSESAIIKSGSNQHSVSAEGDFSFVFRQIAGITIANFRSVLVFLSYAAARPSGWSLVSKFVAAKSGNDSDSVNEVENLDLGLQGKMTSDVQKRLQVVDEIIEEFEGGLERLFRQLVQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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