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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004276`

染色体: Chr02 坐标: 64954210-64956441 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004276`
名称	SmilChr02G004276
描述	lysine histidine transporter-like 8
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64954210 - 64956441 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012996`
GeneID	`131012996`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012996`
原始查询	`SmilChr02G004276`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lysine histidine transporter-like 8
产物	lysine histidine transporter-like 8
Arabidopsis	`AT1G47670` (AT1G47670) Transmembrane amino acid transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841177] identity=50.8; qcov=1.01; evalue=2.52e-180; confidence=high
Rice	`Os04g0562100` (OsLHT7) - identity=56.6; qcov=0.917; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01490 (Aa_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012996

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057796978.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796978.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796978.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796978.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796978.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64954381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:64954628`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B12
`Chr2:64954628`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B12
`Chr2:64954946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B23,B49,B52,C39
`Chr2:64955393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B136,C80
`Chr2:64955394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,C64,C66
`Chr2:64955439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr2:64955469`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr2:64955497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B50,C23
`Chr2:64955674`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B65
`Chr2:64955674`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B65
`Chr2:64955703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C27,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796978.1

515 aa

258

515

Aa_trans

PF01490 Aa_trans 89-503 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796978.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	89	503	1.4e-59	202.5	Transmembrane amino acid transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940995.1
GATGCTAATAAAGTTGAGAATATTGATATTAAATCGCATGGTTATGAGAGGGAGAATGATTAAACGAGTCGATATTGCCGGTCAGCCCAAGCAGTCTACCTATATACCTTTTTGGTCGCCTCTTCAGGCACTATAATTCAAAGCCCCTCTGATTTTCTTGACAAGCACCAAAATACCCTTAATTACTTCCCTCACCATTCTTATATATATATATATATATATATCAAGCCCTTCACAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012996
ATGCCGGAGATGGTTGAGAATGGCGCAGCAGACGGCGGCGAGATATCAATATCATCGGGGGCGGCGGCTCCCAATCTCATGCAGACCGATCAGTACAACTCACCCTCTCTCTCTGGGAAGCCGTTGTTGATGATCGAGCTGCAGCCAAAGGCGAAGGCAAAAACGCCTAATTTCATAACTCCGTTGGGCAGTCCGATTCGAAGGGCGATGAAGATGACGAGGCTTGACCCTCAAGATGCTTGGCTTCCCATCACAGAGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796978.1
MPEMVENGAADGGEISISSGAAAPNLMQTDQYNSPSLSGKPLLMIELQPKAKAKTPNFITPLGSPIRRAMKMTRLDPQDAWLPITESRNGNAFYSAFHTLCAGIGIQALVVPVAFTILGWSWGIISLTVAFVWQLYTFWLLTNLHESTETGMRYSRFLQLFNATFGEKMGKIFAVFPIMYLSGGTCVALIVVGGSTSKLFYQIVCGGGGCPADPLTTVEWYLVFTSAAVLVSQLPNLNSIAGVSLIGAVTAVGYCTMMWC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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