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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004279`

染色体: Chr02 坐标: 64982505-64983628 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004279`
名称	SmilChr02G004279
描述	uncharacterized SmilChr02G004279
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64982505 - 64983628 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013013`
GeneID	`131013013`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013013`
原始查询	`SmilChr02G004279`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF241 domain protein, putative (DUF241) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843954]; symbol=AT1G76210; hit=AT1G76210; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	DUF241 domain protein, putative (DUF241) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843954]; symbol=AT1G76210; hit=AT1G76210; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G76210` (AT1G76210) DUF241 domain protein, putative (DUF241) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843954] identity=37.2; qcov=0.983; evalue=2.47e-38; confidence=medium
Rice	`Os08g0553700` - identity=24.2; qcov=0.983; evalue=1.86e-07; confidence=weak
GO	GO:0048364 (root development); GO:0048367 (shoot system development)
KEGG	-
Pfam	PF03087 (BPS1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013013

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796996.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057796996.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057796996.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796996.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796996.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64983023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C20
`Chr2:64983134`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B85,C29,D2
`Chr2:64983204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B3,B45,B62
`Chr2:64983332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:64983355`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	33	A13,A25,B1,B11,B117,B12,B137,B140,B2,B3,B38,B43,B50,B62,B67,B94,B95,C10,C15,C31,C34,C39,C40,C45,C59,C63,C70,C73,C81,C82,C85,D2,D3
`Chr2:64983358`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	31	A13,A25,B1,B117,B12,B137,B140,B2,B3,B38,B43,B50,B62,B67,B95,C10,C15,C31,C34,C39,C40,C45,C59,C63,C70,C73,C81,C82,C85,D2,D3
`Chr2:64983365`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:64983368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C20
`Chr2:64983375`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B50,B67,C34,C59,C73
`Chr2:64983375`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B50,B67,C34,C59,C73
`Chr2:64983377`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B50,B67,C34,C59,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796996.1

235 aa

118

235

BPS1

PF03087 BPS1 8-232 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796996.1`	Pfam	`PF03087`	BPS1	Family	8	232	2.1e-46	159.4	Protein BPS1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941013.1
AAGTCATAATCCACAACCACAAACTACGTGATCGATCAAGATTCCTTTGTTTTTCCAAGTCAAGAATAGCTCCTACGCTTCAAACTTTTGATTAATCTTTCCATTTCCTCATCCTATAAGTAGAATTCAACACCACGAACAAAATTTACATTATTTGATAATCTCATAGATACAACAACAACGGCAACAATGTCTAAAACCGAATTCGACTTCGATTCTTTGAACGAGTTCCACGACTCAGTGAACGAGTTGCTGAGTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013013
ATGTCTAAAACCGAATTCGACTTCGATTCTTTGAACGAGTTCCACGACTCAGTGAACGAGTTGCTGAGTTCGCCGGGGATGAAGCTTGAGATCAGTGATCGCGGGCAGGAGAAGCTGGCGCACGACGTCTCGGAGGCGTCGCTGAAGATGGCGGACTCCTGCGCCGCCGCGAAGGACCTCCTCCTCCTGGCCAAGGACCACCTCCAGAGCCTGCAGTCAGCGTTCCGCCGCATTGCCGGCGCGGCGGACCACACGGGCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796996.1
MSKTEFDFDSLNEFHDSVNELLSSPGMKLEISDRGQEKLAHDVSEASLKMADSCAAAKDLLLLAKDHLQSLQSAFRRIAGAADHTGSSIAHHRLPRKQLKKAIMKRLDSLKGMKNSFSAGAEKEEEEESLAVVVKLLKEVRATTMSIVRSLLSLIAIPHPGSKAESGRRDPIFRIKLTRVDSLSFWEKCDVADIRTMMKRLEEVEMVVDDMGAELEDMFRKLIRTRASLLNIITA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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