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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004287`

染色体: Chr02 坐标: 65174032-65180658 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004287`
名称	SmilChr02G004287
描述	serine/threonine-protein kinase BSK1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	65174032 - 65180658 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012998`
GeneID	`131012998`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012998`
原始查询	`SmilChr02G004287`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein kinase BSK1-like
产物	serine/threonine-protein kinase BSK1-like
Arabidopsis	`AT4G35230` (BSK1) BR-signaling kinase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829676] identity=79.9; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0132800` (OsRLCK98) - identity=75.2; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0009742 (brassinosteroid mediated signaling pathway)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF25575 (TPR_BSK1_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012998

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057796980.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057796980.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796980.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796980.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796980.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:65175053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr2:65175079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B121,C80
`Chr2:65175154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C48,D8
`Chr2:65179763`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr2:65180002`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B46,B69,C26,C4,C5
`Chr2:65180049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr2:65180124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B9
`Chr2:65180185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796980.1

495 aa

248

495

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

TPR_BSK1_C

PF00069 Pkinase 72-307 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 72-310 aa PF25575 TPR_BSK1_C 346-462 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796980.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	72	307	5.8e-24	85.6	Protein kinase domain
`XP_057796980.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	72	310	2.9e-27	96.3	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057796980.1`	Pfam	`PF25575`	TPR_BSK1_C	Repeat	346	462	1.2e-59	200.0	Serine/threonine-protein kinase BSK1-like, TPR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940997.1
ACATTAAATATGATCAACCAAATATAGCAAAGAGACCAAAGCATATTTGCTGAAAGCTGACCAGAGAACTGCAAATAGTGTGATAATGAAAACTAAATAGAAAAAAAAGCAGTAGAAGTAATCAAAACTAAAATCCCAACACTCCCCAAGATTTTACTTTCACCAAAGTTTTAAACTTTTGAGATCCCTTTTTCTCCTCATAACACGCACGAACGAATTCTTTAATCTTTATTGCTAAAAGAAACCGCATTTAAAAATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012998
ATGGGCTGCTGCGTATCTAAAGGGTATCCTCCGCGCGCGGCGGACAAGGATCAGCAGCAGCTGCAGCTGCAGCACGGCCACCGTCGCTCCTCCTCCGTGAATGGAGCGGCCACCGGCGGATTCGCGGAGTTCTCGCTGGCGGAGCTGAAGGCCGCCACCAGCAACTTCAGCTCCGACAAAATCGTCTCGGAGAGTGGCGAGAAAGCGCCCAATGTCGTCTACGAAGGCCGCCTTCAGAACCAGCGCTGGATCGCTGTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796980.1
MGCCVSKGYPPRAADKDQQQLQLQHGHRRSSSVNGAATGGFAEFSLAELKAATSNFSSDKIVSESGEKAPNVVYEGRLQNQRWIAVKKFTKMAWPDPKQFAEEAKEVGKLRHKRLANLIGYCCDGDERLLVAEFMPNETLAKHLFHWENQTPEWAMRLRVALYIAEALDYCTREGRPLYHDLNAYRVLFDENGDPRLSCFGLMKNSRDGKSYSTNLAYTPPEYLRNGRVTQESVVFSFGTVLLDLLSGKHIPPSHALDMI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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