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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004289`

染色体: Chr02 坐标: 65215359-65215745 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004289`
名称	SmilChr02G004289
描述	uncharacterized SmilChr02G004289
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	65215359 - 65215745 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009893`
GeneID	`131009893`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009893`
原始查询	`SmilChr02G004289`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=46.1; qcov=0.797; evalue=1.53e-19; confidence=low
Rice	`Os01g0872900` - identity=56; qcov=0.906; evalue=3.15e-36; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009893

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793278.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057793278.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057793278.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793278.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793278.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:65215364`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	27	A19,A4,A7,B10,B105,B111,B118,B121,B13,B134,B136,B138,B29,B33,B34,B45,B63,B75,B8,B83,B85,B87,C48,C53,C56,C7,C80
`Chr2:65215368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr2:65215421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr2:65215469`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	B106,B119,B73,B78,C17,C36,C38,C46,C50,C63,C64,C66,C72,C82
`Chr2:65215479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B2,C12,C74
`Chr2:65215503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr2:65215517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B108,B50,B78,C23,C82,D10,D11
`Chr2:65215540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,C19,C36,D10
`Chr2:65215561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,C19,C36,D10
`Chr2:65215562`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B10,B63,B75,B8,B83,C56,C7
`Chr2:65215581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr2:65215592`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937295.1
ATGCGGCATGCATTGTTTTTGCGCATCGTCAACGCCATGCAGTTCGATCCGTACTTCCAACAACGCACGGATGCACTTGGCAGACTCGACTTCACACCGTTGCAGAAATGCACTTTTGCTATTCTTCAAGTAGCAAATGGAGGTGCAGCTGACCAGTACGACGAGTATCTACAGATTGTGGATTCTACCTCGTTGGAGTGCTTCCGCAGATTTTATCGAGTCATCAACCAACTTTTCGGCGCGGAATACTTGAGGAGGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009893
ATGCGGCATGCATTGTTTTTGCGCATCGTCAACGCCATGCAGTTCGATCCGTACTTCCAACAACGCACGGATGCACTTGGCAGACTCGACTTCACACCGTTGCAGAAATGCACTTTTGCTATTCTTCAAGTAGCAAATGGAGGTGCAGCTGACCAGTACGACGAGTATCTACAGATTGTGGATTCTACCTCGTTGGAGTGCTTCCGCAGATTTTATCGAGTCATCAACCAACTTTTCGGCGCGGAATACTTGAGGAGGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793278.1
MRHALFLRIVNAMQFDPYFQQRTDALGRLDFTPLQKCTFAILQVANGGAADQYDEYLQIVDSTSLECFRRFYRVINQLFGAEYLRRPTSADCQRLLALHEEKHGFSGILGSLDYMPRLNFIFNENLEF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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