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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004302`

染色体: Chr02 坐标: 65386812-65391703 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004302`
名称	SmilChr02G004302
描述	lecithin-cholesterol acyltransferase-like 4
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	65386812 - 65391703 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013042`
GeneID	`131013042`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013042`
原始查询	`SmilChr02G004302`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lecithin-cholesterol acyltransferase-like 4
产物	lecithin-cholesterol acyltransferase-like 4
Arabidopsis	`AT4G19860` (AT4G19860) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827730] identity=63.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0615100` - identity=60.5; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004620 (glycerophospholipase activity); GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0008374 (GO:0008374)
KEGG	smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00592 (alpha-Linolenic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02450 (LCAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013042

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057797019.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057797019.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057797019.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057797019.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797019.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:65387054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:65387273`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A2,B115,B122,B127,B138,B7,B73,B81,C69
`Chr2:65387368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B86
`Chr2:65387383`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C23
`Chr2:65387383`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C23
`Chr2:65387956`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr2:65388033`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C26
`Chr2:65388033`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C26
`Chr2:65391222`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,C20,C33
`Chr2:65391273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B34
`Chr2:65391374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797019.1

538 aa

269

538

LCAT

PF02450 LCAT 90-231 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797019.1`	Pfam	`PF02450`	LCAT	Family	90	231	3.1e-25	90.0	Lecithin:cholesterol acyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941036.1
GTAAAGTAACTAAGGGGTGAGGACGCAAACGTGAAACGTGCATGATTGATCAACAAAATCAAATTAATCTTATCCTCGTTTTCAATTCTTCTCCGCCACCGCTGACCACGGCACCACCACCCACCCTCAAATAGATCTTCTCCGATTCTCTACAAACTCCTTGTAAATAACCAATCAAACCATAATCCTAAAATTCAACCGATTCTCTACACTAAGCATCGCTTAATTATTCAAGATTTGCGGAGAGGGTTTATATTGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013042
ATGGCGGTGTTGTTGGAGGACATAGTGAAGTCGGTGGAGCATCTGCTGAAGCTTATCAGCAAGACCAGCCAGGAACAGACCTATGTGGACCCCACGCTCGATCCGGTTCTTCTCGTGCCCGGGATCGCCGGTTCCATTCTCAACGCCGTCGACTCCGAAACGGGTCGGACCGAGCGGGTCTGGGTCCGGATTCTTGGGGCTGATCACGAGTTCCGGGACAAGCTCTGGTCCCGCTTCAATCCTGCTACAGGTAAGACAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797019.1
MAVLLEDIVKSVEHLLKLISKTSQEQTYVDPTLDPVLLVPGIAGSILNAVDSETGRTERVWVRILGADHEFRDKLWSRFNPATGKTECLDPGTHIEIPQDRYGLYAIDMLDPDMIIGSECVYYFHDMIVEFIKWGYKEGTTLFGFGYDFRQSNRLQETLDRFAAKLESVYTASGGRKINIISHSMGGLLTKCFMSLHADIFEKYVKSWIAIAAPFQGAPGYITSTFLNGASFVEGWEQNFFISKWSMQQLLLECPSIYEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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