当前解析结果
SmilChr02G004303| 统一新 Gene ID | SmilChr02G004303 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G004303 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G004303 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 65419697 - 65421066 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131013044 |
|---|---|
| GeneID | 131013044 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131013044 |
| 原始查询 | SmilChr02G004303 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | polyadenylate-binding protein 1-B-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834516]; symbol=AT5G44860; hit=AT5G44860; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | polyadenylate-binding protein 1-B-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834516]; symbol=AT5G44860; hit=AT5G44860; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT5G44860 (AT5G44860)polyadenylate-binding protein 1-B-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834516] identity=73.8; qcov=1.01; evalue=1.54e-161; confidence=high |
| Rice | Os01g0800300- identity=52.3; qcov=1.04; evalue=9.8e-102; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF29520 (DUF8558) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131013044 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Vacuole | 液泡 | 0.60000 | XP_057797020.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.40000 | XP_057797020.1 |
| 3 | Vacuole membrane | 液泡膜 | 0.40000 | XP_057797020.1 |
| 4 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.20000 | XP_057797020.1 |
| 5 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.20000 | XP_057797020.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:65420137 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C39 |
Chr2:65420730 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B67 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057797020.1PF29520
DUF8558 1-314 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057797020.1 |
Pfam | PF29520 |
DUF8558 | Domain | 1 | 314 | 3.9e-105 | 352.5 | Domain of unknown function (DUF8558) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。