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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004312`

染色体: Chr02 坐标: 65471292-65472692 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004312`
名称	SmilChr02G004312
描述	uncharacterized SmilChr02G004312
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	65471292 - 65472692 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013054`
GeneID	`131013054`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013054`
原始查询	`SmilChr02G004312`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0560700; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os09g0560700; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G30910` (AT1G30910) Molybdenum cofactor sulfurase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839975] identity=57.6; qcov=0.984; evalue=8.01e-133; confidence=high
Rice	`Os09g0560700` - identity=59.7; qcov=0.987; evalue=4.38e-136; confidence=high
GO	GO:0003824 (catalytic activity); GO:0030151 (molybdenum ion binding); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding)
KEGG	-
Pfam	PF03473 (MOSC); PF03476 (MOSC_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013054

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057797039.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057797039.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057797039.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797039.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797039.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:65471416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,C20,C33
`Chr2:65471470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B26
`Chr2:65471470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr2:65471560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr2:65471738`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	69	A16,A18,A2,A4,B1,B10,B101,B103,B105,B109,B110,B111,B12,B125,B127,B129,B130,B132,B133,B134,B140,B17,B26,B29,B31,B32,B33,B34,B36,B4,B42,B43,B55,B58,B64,B69,B70,B8,B81,B82,B85,B87,B90,B92,B93,B98,C18,C2,C22,C24,C25,C28,C30,C32,C35,C40,C57,C60,C61,C68,C71,C73,C74,C79,C81,C85,D2,D4,D6
`Chr2:65471741`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	69	A16,A18,A2,A4,B1,B10,B101,B103,B105,B109,B110,B111,B12,B125,B127,B129,B130,B132,B133,B134,B140,B17,B26,B29,B31,B32,B33,B34,B36,B4,B42,B43,B55,B58,B64,B69,B70,B8,B81,B82,B85,B87,B90,B92,B93,B98,C18,C2,C22,C24,C25,C28,C30,C32,C35,C40,C57,C60,C61,C68,C71,C73,C74,C79,C81,C85,D2,D4,D6
`Chr2:65471798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr2:65472418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr2:65472497`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D11
`Chr2:65472497`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D11
`Chr2:65472587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B138,B16,C5,C64,C7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797039.1

314 aa

157

314

MOSC_N

MOSC

PF03476 MOSC_N 4-138 aa PF03473 MOSC 161-299 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797039.1`	Pfam	`PF03476`	MOSC_N	Domain	4	138	4.2e-32	111.2	MOSC N-terminal beta barrel domain
`XP_057797039.1`	Pfam	`PF03473`	MOSC	Domain	161	299	2.4e-21	76.7	MOSC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941056.1
TGTGAGTGTATAAATAGGGGCCGGGTAAGGAATGAAATTGAGTGGGGAAATTAAAGAAAAAGCAGTGTCTGGAGAGTGGAGATGGTAATTGCAGTGAAGGCAATATATGTGTACCCAATAAAATCATGCGGTGGAATATCTGTTGCGGAGGCTCCCATCTCCTCCACTGGATTCCGGTGGGATCGGCAGTGGGTGGTGGTCAACTCCAAAGGCAGGGCTGTAACACAAAGAGTGGAACCAAAGCTAGCTCTCGTTCAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013054
ATGGTAATTGCAGTGAAGGCAATATATGTGTACCCAATAAAATCATGCGGTGGAATATCTGTTGCGGAGGCTCCCATCTCCTCCACTGGATTCCGGTGGGATCGGCAGTGGGTGGTGGTCAACTCCAAAGGCAGGGCTGTAACACAAAGAGTGGAACCAAAGCTAGCTCTCGTTCAAACCCAACTCCCACATGAAGCATTTTCACTCGATTGCCACCCAAGCAACCACTCTTTTTTAGAGATAAAGGCCCCAGGCATGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797039.1
MVIAVKAIYVYPIKSCGGISVAEAPISSTGFRWDRQWVVVNSKGRAVTQRVEPKLALVQTQLPHEAFSLDCHPSNHSFLEIKAPGMEVLKVALVKSSSSSSSGSGEKVDGISVWEWSGSAVDEGAAAAQWFSNYLGKPSRLVRFNHVSGVRKVEADYAPGYNVMFADMYPFLLLSQGSMDALNARLKEPVAVNRFRPNILVDGCEPFCEDLWTEMRIKNATFKGVKLCSRCKVPTVNQETGTAGGSEPTDTLLSFRSDKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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