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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004315`

染色体: Chr02 坐标: 65480358-65484002 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004315`
名称	SmilChr02G004315
描述	methylthioribose-1-phosphate isomerase
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	65480358 - 65484002 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013061`
GeneID	`131013061`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013061`
原始查询	`SmilChr02G004315`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	methylthioribose-1-phosphate isomerase
产物	methylthioribose-1-phosphate isomerase
Arabidopsis	`AT2G05830` (AT2G05830) NagB/RpiA/CoA transferase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815134] identity=74; qcov=0.973; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0216900` (OsIDI2) - identity=72.5; qcov=0.96; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0019509 (GO:0019509); GO:0046523 (S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase activity)
KEGG	smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01008 (IF-2B)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013061

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057797046.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057797046.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057797046.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797046.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797046.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:65480968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,C2,C32,C68
`Chr2:65480977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B120,B77
`Chr2:65480998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr2:65481713`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B44
`Chr2:65481713`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B44
`Chr2:65481778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,C31,C7
`Chr2:65481795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr2:65482049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,C31,C33,D1,D10
`Chr2:65482114`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	119	A1,A10,A13,A16,A18,A21,A22,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,B10,B100,B103,B104,B105,B108,B109,B11,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B12,B120,B125,B126,B127,B129,B132,B134,B14,B140,B16,B18,B19,B20,B21,B22,B24,B27,B28,B29,B33,B34,B36,B39,B42,B43,B48,B49,B50,B53,B58,B62,B63,B65,B66,B67,B7,B70,B74,B75,B77,B8,B82,B83,B84,B85,B87,B89,C11,C13,C17,C18,C2,C22,C23,C24,C26,C27,C28,C3,C30,C32,C33,C35,C36,C38,C4,C40,C44,C45,C46,C49,C50,C53,C55,C57,C62,C68,C69,C70,C74,C76,C77,C8,C80,C81,C83,C86,D4,D8
`Chr2:65482117`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	119	A1,A10,A13,A16,A18,A21,A22,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,B10,B100,B103,B104,B105,B108,B109,B11,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B12,B120,B125,B126,B127,B129,B132,B134,B14,B140,B16,B18,B19,B20,B21,B22,B27,B28,B29,B33,B34,B36,B39,B42,B43,B48,B49,B50,B53,B58,B62,B63,B65,B66,B67,B7,B70,B74,B75,B77,B8,B82,B83,B84,B85,B87,B89,C11,C13,C17,C18,C2,C22,C23,C24,C26,C27,C28,C3,C30,C32,C33,C35,C36,C38,C4,C40,C44,C45,C46,C49,C50,C53,C55,C57,C62,C68,C69,C70,C73,C74,C76,C77,C8,C80,C81,C83,C86,D4,D8
`Chr2:65483073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797046.1

375 aa

188

375

IF-2B

PF01008 IF-2B 55-356 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797046.1`	Pfam	`PF01008`	IF-2B	Family	55	356	7.4e-76	255.8	Initiation factor 2 subunit family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941063.1
TTAAAGTTTACTATAGATAAGAAAGCTTCCATATACCCAGACTGACAGCAATTTCCTCTCTGCACCGCCGCCGCCACCTCTCCTCGGCAACGCCTCACCACCAGATCAAGATTAAACTGAAAGAAGCAGAAAACCAAGTTAGCAATGGCTGATGAGGTTGGGATAGAACAGCAGAATTCCCTACAGTCGATATGCTACAAACGGGGATCGCTTCAATTGCTTGATCAGAGAAAGCTTCCACTTGAGACCATATATCTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013061
ATGGCTGATGAGGTTGGGATAGAACAGCAGAATTCCCTACAGTCGATATGCTACAAACGGGGATCGCTTCAATTGCTTGATCAGAGAAAGCTTCCACTTGAGACCATATATCTGGATGTCAGAGATTCAAAAGACGGATGGGTTGCCATAAAGGACATGGTTGTGCGTGGTGCACCAGCCATTGCCATAGCTGCTGCTCTCTCCTTGGCTGTGGAAGTTTCCAATTTAGGGGCATTTAGTGGGACTCCTAATGATGCAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797046.1
MADEVGIEQQNSLQSICYKRGSLQLLDQRKLPLETIYLDVRDSKDGWVAIKDMVVRGAPAIAIAAALSLAVEVSNLGAFSGTPNDAASFLSNKLDYLVSSVPTAVNLSDAATKLKEVVHKATATAADVQTVYQTYIEAAEKMLVDDVASNKSIGHHGASLIQKQQAASTSLSVLTHCNTGSLATAGYGTALGVIRALHEKGVLGMAYCTETRPFNQGSRLTAFELVHDNIPATLVADSAAAALMKAGQVNAVVVGADRVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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