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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004319`

染色体: Chr02 坐标: 65508004-65510566 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004319`
名称	SmilChr02G004319
描述	pollen receptor-like kinase 4
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	65508004 - 65510566 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013062`
GeneID	`131013062`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013062`
原始查询	`SmilChr02G004319`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pollen receptor-like kinase 4
产物	pollen receptor-like kinase 4
Arabidopsis	`AT5G35390` (PRK1) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833500] identity=43; qcov=1.02; evalue=7.11e-174; confidence=medium
Rice	`Os08g0521200` (OsRLCK258) - identity=40.8; qcov=0.994; evalue=5.82e-156; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08263 (LRRNT_2); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013062

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797047.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797047.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797047.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797047.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797047.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:65508159`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:65508160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,C2,C32,C68
`Chr2:65508213`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C24
`Chr2:65508213`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C24
`Chr2:65508215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr2:65508227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B26,D11
`Chr2:65508230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr2:65508236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr2:65508241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B35
`Chr2:65508252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B7
`Chr2:65508255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B81,B94
`Chr2:65508256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797047.1

670 aa

335

670

LRRNT_2

LRR_8

LRR_1

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF08263 LRRNT_2 35-73 aa PF13855 LRR_8 101-161 aa PF00560 LRR_1 126-143 aa PF00560 LRR_1 150-170 aa PF00560 LRR_1 195-215 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 392-586 aa PF00069 Pkinase 392-663 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797047.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	35	73	2.9e-08	34.6	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057797047.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	101	161	1.2e-13	51.3	Leucine rich repeat
`XP_057797047.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	126	143	3.4e-14	50.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057797047.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	150	170	3.4e-14	50.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057797047.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	195	215	3.4e-14	50.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057797047.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	392	586	1.4e-22	81.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057797047.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	392	663	3.5e-24	86.3	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941064.1
TCTCTCTCTCTAACTTTTTTCGTTACGTAGAAGAATCAGATGAGACTCATACAGAAACGGAAACGCCAAATCCATGACCATGTCTTGTGCGGGTTGAAGTCGACCTTACTTTCAAAGAAGCAATTGCATTTGCATAGTCGAGATTATGAATAATGCGGAAGCAAACTGGTGCTGCAATGAACATAATAGTGGTGATGGTGATGGTGGTGGCGGTGGCCCCGCACGTGTTGGGGCAGCCGCAAGAAAACGCAGCGGAGACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013062
ATGCGGAAGCAAACTGGTGCTGCAATGAACATAATAGTGGTGATGGTGATGGTGGTGGCGGTGGCCCCGCACGTGTTGGGGCAGCCGCAAGAAAACGCAGCGGAGACTCTCATGAAATTCAAAACTGCTCTAACCAATTCGGATCCAGCGCTAGCCAATTGGAATCCATCCAAGCCACCGTGTACGGGGAACACAGGCAATTGGGCCGGCGTACTGTGCTACAACGGCTACGTGTGGGGCCTACAGCTCGACAATATGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797047.1
MRKQTGAAMNIIVVMVMVVAVAPHVLGQPQENAAETLMKFKTALTNSDPALANWNPSKPPCTGNTGNWAGVLCYNGYVWGLQLDNMRLQGQINVDSLATLPYLRSLSFINNNFQGSMPDWRKLPTLKSLYLSGNHFSGQIPNDAFDGMDSLKRVYLSNNQFSGPIPASLTSSRMVEVGLDNNQFSGAIPTVDSQNLQVFNVSNNQLQGPVPPSLLRMDPSSFTGNKALCGGPEGPSCDPPKPPPDLEPLLHAPPNAHAPP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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