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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004323`

染色体: Chr02 坐标: 65533577-65539802 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004323`
名称	SmilChr02G004323
描述	ribonuclease E/G-like protein, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	65533577 - 65539802 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013067`
GeneID	`131013067`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013067`
原始查询	`SmilChr02G004323`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ribonuclease E/G-like protein, chloroplastic
产物	ribonuclease E/G-like protein%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G04270` (RNEE/G) RNAse E/G-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814965] identity=63.2; qcov=0.817; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0323600` (OSJNBa0078D03.16-2) - identity=54.2; qcov=0.911; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0004540 (RNA nuclease activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006364 (rRNA processing)
KEGG	-
Pfam	PF10150 (RNase_E_G)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013067

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057797051.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057797051.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797051.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797051.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797051.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:65534358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:65534392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B63,B75,B83,C4,D11
`Chr2:65534802`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C80
`Chr2:65535181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B97,C31
`Chr2:65535334`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	52	A15,A2,A9,B102,B110,B114,B119,B122,B123,B126,B136,B137,B2,B27,B30,B35,B38,B39,B40,B44,B5,B51,B53,B57,B6,B64,B66,B69,B77,B87,B88,C10,C12,C13,C14,C16,C37,C39,C48,C51,C52,C54,C59,C67,C72,C74,C75,C78,C81,C84,D3,D7
`Chr2:65535337`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	53	A15,A2,A9,B102,B110,B114,B119,B122,B123,B126,B136,B137,B2,B27,B30,B35,B38,B39,B40,B44,B5,B51,B53,B57,B6,B64,B66,B69,B77,B87,B88,C10,C12,C13,C14,C16,C37,C39,C48,C51,C52,C54,C59,C67,C72,C74,C75,C78,C81,C84,D1,D3,D7
`Chr2:65535511`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr2:65535548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr2:65537297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C70
`Chr2:65538432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr2:65539358`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:65539540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,B31,B46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797051.1

907 aa

454

907

RNase_E_G

PF10150 RNase_E_G 477-756 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797051.1`	Pfam	`PF10150`	RNase_E_G	Family	477	756	1.6e-86	290.8	Ribonuclease E/G family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941068.1
ATGTTGAATGTAGATAAACCCCAACGCGACACAAGAGAAGAGATTGAGGAGGAGGTCGAGGTGAGCTGCTGCGTAGCTCCTGCTCCCTCATGTTGTAAATTGGAAAACCGTCGCCCATTTTGCACGTCTGTCAATGGATTTTCGACCAACTTCTCATAGGCACCTTGAAGTGAATAAAGTCTAAGTCTTTTGCAAACCAAGACATGTGGACATCTTCTGATGTCTTGTGGGGAACCAGAGTCCAATATTCTGTGCTGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013067
ATGTGGACATCTTCTGATGTCTTGTGGGGAACCAGAGTCCAATATTCTGTGCTGCCATATTCGCCAAGCCAACAATGTAGAAAATGTACGGGAAAGCTCAAACCTCGTAATAGGAGAAAACCGGTATTTCAGTCATGGTTTGGGAAGAGAACTCAACGGTTCCTCCTTCCTGCTTTATCAAGAGATGATGACAAGATTGCAAGATGTTGTGGAAGTTACTACTTGGCGTCCAACTTATTCTTCAGTGATTGCCAAGTTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797051.1
MWTSSDVLWGTRVQYSVLPYSPSQQCRKCTGKLKPRNRRKPVFQSWFGKRTQRFLLPALSRDDDKIARCCGSYYLASNLFFSDCQVSCSRIPRNSHITEAFPIRDQVVEEPWLLQPSFGAHHFADIYTSSDIDNEREILNCSNGSLQKSEMLNQSSHGEDFNHKSKYNMNEMDISEHSDSLLTNDMVEEPWIFESACSRVKEVPGVLRNELVKDEVTQSALSEPHHPTPENLLHEEENSKMTKEDSVSTVILINSSICTV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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