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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004342`

染色体: Chr02 坐标: 65674881-65678148 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004342`
名称	SmilChr02G004342
描述	ethylene-responsive transcription factor RAP2-12-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	65674881 - 65678148 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013088`
GeneID	`131013088`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013088`
原始查询	`SmilChr02G004342`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ethylene-responsive transcription factor RAP2-12-like
产物	ethylene-responsive transcription factor RAP2-12-like
Arabidopsis	`AT1G53910` (RAP2.12) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841829] identity=42.1; qcov=1.05; evalue=1.34e-67; confidence=medium
Rice	`Os06g0194000` (ERF71) - identity=42; qcov=1.03; evalue=1.8e-71; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009873 (ethylene-activated signaling pathway)
KEGG	-
Pfam	PF00847 (AP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013088

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797074.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797074.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797074.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797074.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057797074.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:65675188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr2:65675221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr2:65675377`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B7
`Chr2:65675408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:65676648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C82,D10,D11
`Chr2:65676901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,C2,C32,C68
`Chr2:65676973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C82,D10,D11
`Chr2:65676990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C14
`Chr2:65677341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797074.1

380 aa

190

380

AP2

PF00847 AP2 119-168 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797074.1`	Pfam	`PF00847`	AP2	Domain	119	168	1.3e-12	48.5	AP2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009097581.1
AAAGCCGCCTCGCTCTTATCACCCTCTGCGTATAAAAATGCAGAAGCACTTCTTACAACATCTCAATAAAATCTCGATTTTTTAGGAAAACGATTTCCATTTTCATAGCAATCACTGTAAAAATTGCAGGCGATTTCTCGAAATGTGCGGAGGAGCTATAATCTCCGAAATCACGCCGCCGACGAGCCTATCGTCGCGCCGCCTCACCGCCGACTTGCTATGGGGCAGCGGCGCCGCCGCTCTGAGGAAGAAGAAGAATA...

XM_057941091.1
AGTGAAAATTGTGCAATTTCATGCAAATGCAATTTCGAACAAAATCAAGGGTATTATAGTCCAATCAAGCCTCCCAAATCTCAATTACACCCATTCTACAGGGGTATAACCGTAAAATCAGGAAAAAGCCGCCTCGCTCTTATCACCCTCTGCGTATAAAAATGCAGAAGCACTTCTTACAACATCTCAATAAAATCTCGATTTTTTAGGAAAACGATTTCCATTTTCATAGCAATCACTGTAAAAATTGCAGGCGATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013088
ATGTGCGGAGGAGCTATAATCTCCGAAATCACGCCGCCGACGAGCCTATCGTCGCGCCGCCTCACCGCCGACTTGCTATGGGGCAGCGGCGCCGCCGCTCTGAGGAAGAAGAAGAATAATTGTAACTATTACTCAAAGCCGCTCAGATCTAGGCCTATCTCTGACTTCGATGATGACTTCGAAGCCGATTTTCAGGATTTTGAGGATTACTCCGATGAGGAGGAGGAGCTCGATTTGAAGAAGCCGTTCGCGTTCTCTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797074.1
MCGGAIISEITPPTSLSSRRLTADLLWGSGAAALRKKKNNCNYYSKPLRSRPISDFDDDFEADFQDFEDYSDEEEELDLKKPFAFSAPKNIGVKAHKSLDPAESDEDAEKSSKRKRKNQYRGIRQRPWGKWAAEIRDPRKGVRVWLGTFNTAEEAARAYDIEARRIRGNKAKVNFPEDVPVSAASKRTLKVSSRKVSSNENSESGQYNLDQNMSFTSMLSNNYYDSLSLMEEKPQMKQYGYGDVGLKPLTPSDGSSVYFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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