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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004343`

染色体: Chr02 坐标: 65693477-65704341 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004343`
名称	SmilChr02G004343
描述	uncharacterized SmilChr02G004343
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	65693477 - 65704341 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013089`
GeneID	`131013089`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013089`
原始查询	`SmilChr02G004343`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820637]; symbol=AT3G14200; hit=AT3G14200; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820637]; symbol=AT3G14200; hit=AT3G14200; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G14200` (AT3G14200) Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820637] identity=69.7; qcov=0.632; evalue=2.24e-62; confidence=high
Rice	`Os06g0195800` (OsDjC53) - identity=57.3; qcov=0.526; evalue=9.49e-32; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00226 (DnaJ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013089

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057797075.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057797075.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057797078.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797075.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797075.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:65702799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B34
`Chr2:65703777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr2:65704000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C14
`Chr2:65704044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797075.1

232 aa

116

232

DnaJ

PF00226 DnaJ 10-78 aa

XP_057797076.1

232 aa

116

232

DnaJ

PF00226 DnaJ 10-78 aa

XP_057797078.1

209 aa

104

209

DnaJ

PF00226 DnaJ 10-78 aa

XP_057797079.1

209 aa

104

209

DnaJ

PF00226 DnaJ 10-78 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797075.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	10	78	3.1e-20	72.7	DnaJ domain
`XP_057797076.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	10	78	3.1e-20	72.7	DnaJ domain
`XP_057797078.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	10	78	2.5e-20	73.0	DnaJ domain
`XP_057797079.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	10	78	2.5e-20	73.0	DnaJ domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941092.1
TCACTAACCCCGCAATCCTTATCTAGCCCACCTTCATTGTCTTGGCAACTTTTCCCAAGTATTCAATGTTCCAATTCTCTTACCTTTTTAATAATAACTGCACGTATATATATATATAAAATAATTGTAAAAACCAACCTTTCTGGAGGCTTCTAAGGAGAGAGCTATTGATCTCCCCCTCTAAAAAAATGCTGAGGTTTCGTGGTGCTGTAATCTTGCAGCCTTTGTTGAATACTACTGCGTTTTGCAGATTGTCGCAT...

XM_057941095.1
CTTGGCAACTTTTCCCAAGTATTCAATGTTCCAATTCTCTTACCTTTTTAATAATAACTGCACGTATATATATATATAAAATAATTGTAAAAACCAACCTTTCTGGAGGCTTCTAAGGAGAGAGCTATTGATCTCCCCCTCTAAAAAAATGCTGAGGTTTCGTGGTGCTGTAATCTTGCAGCCTTTGTTGAATACTACTGCGTTTTGCAGATTGTCGCATATAAATTTATGCGTGTGTGCGTGATTTGTATAATCTTGAA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131013089
ATGGCAGCTGAGGAAGAGAAAAACAGTGATTTCTATGCTGTTATGGGGCTGAAGAAAGAATGCACGCCAGCTGAGCTGAGAAATGCCTACAAGAAACTTGCAATGAAATGGCATCCGGATCGTTGCAGTGCTTCTGCAAATCAAAAGTTTGTGGAAGAGGCAAAGAAAAAATTTCAAGATATTCAGCAAGCTTATTCTGTTCTTTCGGATGCAAACAAAAGGTTTCTGTACGATGTAGGAGTCTATAACAGCGATGATGA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057797075.1
MAAEEEKNSDFYAVMGLKKECTPAELRNAYKKLAMKWHPDRCSASANQKFVEEAKKKFQDIQQAYSVLSDANKRFLYDVGVYNSDDDDDENGMGDFLNEMATMMNQNKSNESRNESFEDLQVLFQELFQSDTDTFGSSSRSTTPPTCVSSQDSCSETSSTSNKRNSSEMSSRKFTTEATRPEGFCIRAEHQQNAGRASGERMPRRARGSSRRDGRKQKISSGHDVSSRGISA

XP_057797076.1
MAAEEEKNSDFYAVMGLKKECTPAELRNAYKKLAMKWHPDRCSASANQKFVEEAKKKFQDIQQAYSVLSDANKRFLYDVGVYNSDDDDDENGMGDFLNEMATMMNQNKSNESRNESFEDLQVLFQELFQSDTDTFGSSSRSTTPPTCVSSQDSCSETSSTSNKRNSSEMSSRKFTTEATRPEGFCIRAEHQQNAGRASGERMPRRARGSSRRDGRKQKISSGHDVSSRGISA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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