当前解析结果
SmilChr02G004353| 统一新 Gene ID | SmilChr02G004353 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G004353 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G004353 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 65796321 - 65800884 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131013101 |
|---|---|
| GeneID | 131013101 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131013101 |
| 原始查询 | SmilChr02G004353 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | FAD-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241114]; symbol=AT3G49645; hit=AT3G49645; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | FAD-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241114]; symbol=AT3G49645; hit=AT3G49645; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT3G49645 (AT3G49645)FAD-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241114] identity=41.6; qcov=0.951; evalue=1.34e-56; confidence=medium |
| Rice | Os10g0360900- identity=33.8; qcov=0.963; evalue=9.28e-40; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF25071 (DUF7795) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131013101 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057797094.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057797094.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057797094.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057797094.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057797094.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:65796833 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B32 |
Chr2:65797025 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B2,C16,D5 |
Chr2:65797081 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B101,C23,D11 |
Chr2:65797839 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr2:65799012 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C64,C66 |
Chr2:65799310 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B91 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057797094.1PF25071
DUF7795 21-142 aa
XP_057797095.1PF25071
DUF7795 9-130 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057797094.1 |
Pfam | PF25071 |
DUF7795 | Domain | 21 | 142 | 3.9e-49 | 166.5 | Domain of unknown function (DUF7795) |
XP_057797095.1 |
Pfam | PF25071 |
DUF7795 | Domain | 9 | 130 | 3.4e-49 | 166.6 | Domain of unknown function (DUF7795) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。