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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004368`

染色体: Chr02 坐标: 65974899-65976827 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004368`
名称	SmilChr02G004368
描述	two-component response regulator ARR1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	65974899 - 65976827 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009897`
GeneID	`131009897`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009897`
原始查询	`SmilChr02G004368`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	two-component response regulator ARR1-like
产物	two-component response regulator ARR1-like
Arabidopsis	`AT3G16857` (RR1) response regulator 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820940] identity=34.4; qcov=0.655; evalue=7.3e-30; confidence=low
Rice	`Os01g0904700` (RR26) - identity=33.6; qcov=0.655; evalue=7.59e-30; confidence=low
GO	GO:0000160 (phosphorelay signal transduction system); GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009897

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793282.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793282.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793282.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793282.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793282.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:65974911`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr2:65974912`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr2:65974912`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr2:65975219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B63,B83,C58
`Chr2:65975543`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B60,B79,C71
`Chr2:65975967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr2:65975982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B55,C23
`Chr2:65975983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr2:65976106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:65976115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B55,C23,C37,D10
`Chr2:65976159`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:65976211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B131,B95,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793282.1

400 aa

200

400

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 207-254 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793282.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	207	254	3.2e-08	34.3	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937299.1
ATGCATGAAATCCATGTTTTGTTAGTTGATCATGACGCAGAAGCCCTAAACATAGCAAAACAGCTCGAAATGTGGCAGTATAAAGTGAGTTGTGCTGAACTTGCTTCTCCTGCTATACCGATGCTTGCAAATGCGAAATTCGATGTTGTGATGGCAAACATCAACTCTCCTGATCCCCATGGATTTAAGCTACTTCTACAACATGCACTCAACATGTGGATGGCCGATGATGATAATGCGTTCGTGGCGATGAGGGCCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009897
ATGCATGAAATCCATGTTTTGTTAGTTGATCATGACGCAGAAGCCCTAAACATAGCAAAACAGCTCGAAATGTGGCAGTATAAAGTGAGTTGTGCTGAACTTGCTTCTCCTGCTATACCGATGCTTGCAAATGCGAAATTCGATGTTGTGATGGCAAACATCAACTCTCCTGATCCCCATGGATTTAAGCTACTTCTACAACATGCACTCAACATGTGGATGGCCGATGATGATAATGCGTTCGTGGCGATGAGGGCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793282.1
MHEIHVLLVDHDAEALNIAKQLEMWQYKVSCAELASPAIPMLANAKFDVVMANINSPDPHGFKLLLQHALNMWMADDDNAFVAMRALENGAFLCIKKPPPMEFLRSLWQHVMREKARMIRERDILVASNNLGSVRGIEFREVVHHRSENPNPKPNPNSNPNPNMMMKNKGKFKTRSRGRYDDYDGEYDSDNNIMSQNGNVRRKMCTEWTQELHAKFMNAVEQLGEGRCFPKEILELMNEPGLTRMQVASHLQKCRNDNWR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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