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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004385`

染色体: Chr02 坐标: 66190295-66193743 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004385`
名称	SmilChr02G004385
描述	protein phosphatase 2C 16-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	66190295 - 66193743 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013129`
GeneID	`131013129`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013129`
原始查询	`SmilChr02G004385`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein phosphatase 2C 16-like
产物	protein phosphatase 2C 16-like
Arabidopsis	`AT1G72770` (HAB1) HYPERSENSITIVE TO ABA1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843609] identity=53.8; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0583100` (OsPP2C06/OsABI2) - identity=63.3; qcov=0.662; evalue=1.04e-154; confidence=high
GO	GO:0004722 (protein serine/threonine phosphatase activity); GO:0006470 (protein dephosphorylation); GO:0043169 (cation binding)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00481 (PP2C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013129

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797140.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057797140.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057797140.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797140.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797140.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:66190654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B95,C14
`Chr2:66191235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr2:66192119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B7,C86
`Chr2:66192124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B7,C86
`Chr2:66192202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C23
`Chr2:66192478`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B113
`Chr2:66192478`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B113
`Chr2:66192487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:66192538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797140.1

523 aa

262

523

PP2C

PF00481 PP2C 238-506 aa

XP_057797141.1

523 aa

262

523

PP2C

PF00481 PP2C 238-506 aa

XP_057797142.1

523 aa

262

523

PP2C

PF00481 PP2C 238-506 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797140.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	238	506	6.4e-61	207.0	Protein phosphatase 2C
`XP_057797141.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	238	506	6.4e-61	207.0	Protein phosphatase 2C
`XP_057797142.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	238	506	6.4e-61	207.0	Protein phosphatase 2C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941157.1
TTAGCCTAATTTCTTTTGTTCTTTCTTTACACAAGCATTGATTGGAGTTAGATAATTGCATCTACACGTGTCCTATGAAGATGTAACGCAAAAAAATAAAAAATTGATCAAAAGATGTAACGCAATTAGTAAATGCTTTTCCACAGCTGCTCCCTCTCTCTCTCCTCTCTTTCTCTCTCTTACCAGCTCAAAAATGAAGGAAAATTGAAAAATCAGCTGCGGAGCGTTATTGCTGAGCATGCTTTCAGCCCTTTTGAGTT...

XM_057941159.1
TTCTTTACACAAGCATTGATTGGAGTTAGATAATTGCATCTACACGTGTCCTATGAAGATGTAACGCAAAAAAATAAAAAATTGATCAAAAGATGTAACGCAATTAGTAAATGCTTTTCCACAGCTGCTCCCTCTCTCTCTCCTCTCTTTCTCTCTCTTACCAGCTCAAAAATGAAGGAAAATTGAAAAATCAGCTGCGGAGCGTTATTGCTGAGCATGCTTTCAGCCCTTTTGAGTTATTGATTTGTTTGTGCTGTTTC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131013129
ATGATGGAAGAGATATCTCCTGCAGCAGTCGCAGTTCCATTTAGTCTAGGCAATCCCGTGTGTGAGAATCCCGCGATTTCAAACCATATGGAGATTGCTCGACTCAAATTAGTGACGGAGACAGCATCGTTGCTGTCTGATCCAGCATTTGGCTGGGATGCTGGTTTTAGTTGTGTGAAAACTGAAACCAGTGAGGTGGATAGCATGCTAGACTCGACACTCGTTAGTGAGAATAGTCAGTCGGGCGGTAGTAATGTTCA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057797140.1
MMEEISPAAVAVPFSLGNPVCENPAISNHMEIARLKLVTETASLLSDPAFGWDAGFSCVKTETSEVDSMLDSTLVSENSQSGGSNVHDSEEDELILFGEGTNLIGSVELLPLDPTSNIAVPLVAASETSVPIAVEIEGVENGQLVAKVISVEEKGIPTGECSSGPAIRESVVSVKLPCERTPGKGGVKSVFELDCVPLWGSVSICGHRPEMEDALMVAPHFMKIPVKLFIGDHGSDGISQTLNQLTSHFFAVYDGHGGSQ...

XP_057797141.1
MMEEISPAAVAVPFSLGNPVCENPAISNHMEIARLKLVTETASLLSDPAFGWDAGFSCVKTETSEVDSMLDSTLVSENSQSGGSNVHDSEEDELILFGEGTNLIGSVELLPLDPTSNIAVPLVAASETSVPIAVEIEGVENGQLVAKVISVEEKGIPTGECSSGPAIRESVVSVKLPCERTPGKGGVKSVFELDCVPLWGSVSICGHRPEMEDALMVAPHFMKIPVKLFIGDHGSDGISQTLNQLTSHFFAVYDGHGGSQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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