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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004396`

染色体: Chr02 坐标: 66301807-66304825 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004396`
名称	SmilChr02G004396
描述	protein IQ-DOMAIN 8-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	66301807 - 66304825 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013145`
GeneID	`131013145`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013145`
原始查询	`SmilChr02G004396`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein IQ-DOMAIN 8-like
产物	protein IQ-DOMAIN 8-like
Arabidopsis	`AT1G72670` (iqd8) IQ-domain 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843599] identity=46.3; qcov=1.03; evalue=1.65e-100; confidence=high
Rice	`Os01g0194200` - identity=43.7; qcov=0.979; evalue=4.16e-79; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00612 (IQ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013145

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057797162.1`
2	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797162.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057797162.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057797162.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797162.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:66302596`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D5
`Chr2:66302596`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D5
`Chr2:66302663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B26,B78,C8,D10
`Chr2:66303439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr2:66303543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B25,B73,D7
`Chr2:66303905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,D7
`Chr2:66304036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:66304054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B16
`Chr2:66304115`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:66304132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A22,B102,B106,B129,B22,B58,B61,B65,B67,B99,C15,C19,C22,C24,C29,C43,C5,C55,C58,C65
`Chr2:66304160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:66304168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797162.1

428 aa

214

428

PF00612 IQ 93-112 aa PF00612 IQ 115-132 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797162.1`	Pfam	`PF00612`	IQ	Motif	93	112	1.4e-05	25.2	IQ calmodulin-binding motif
`XP_057797162.1`	Pfam	`PF00612`	IQ	Motif	115	132	1.4e-05	25.2	IQ calmodulin-binding motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941179.1
CCCGAAACTACGTCGTATTGGTCCGCTCACGACCGTTACAACTTTCCATTTTTCTTCCCTTTTTTCTCTTTTATTCAAACTTTCAAATTTCAAACACTCGCACTTCCGCTCCACTCCGTTAATTAAATATTGATCGAATTTCGAGAACTCCCCAAATCGTTTTCTTCTTCACTTTCCCAATACCATTCTTCTATTTTGTCTCCACATTACAGGAATTAAACGATTTTTGGGAGAATATTTCTTGAAAAAACAAAGAATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013145
ATGGGTGCTTCAGGGAAGTGGATAAAATCTTTGATCGGTCTTAAAAAGGCTTCTGTGAATGAACTCGAAAAAGGAGGTGGTAAGGGAAGGAAGTGGAGGTTATGGAGGAGTGGATCAGGTGGAATAGTCATAGCTAAGGGCGGCAGAGGCGGCGGTGATGGGGCGGAGACGGAGGGATCGGAAGCCTCTTCTTATGCTTTCGACAGTGAAATGGCGGCGGCTGTGGCTGCTCTTGCCAAGGCTTCACCTAAGGATTTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797162.1
MGASGKWIKSLIGLKKASVNELEKGGGKGRKWRLWRSGSGGIVIAKGGRGGGDGAETEGSEASSYAFDSEMAAAVAALAKASPKDFMVVRREWAAVRIQTVFRAFLARRALRALKALVRLQAIVRGRLVRKQAAVTLRCMQALVRVQARVRAHCTQSSAGGLSDKESQVDPKKLVESGWCNSVGTVEEVMSKLQMKQEGAIKRERAFAYALYQQQLRRTPNACSRASKMGTATPARSDKAGAGLNWLERWMATKPWESRL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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