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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004405`

染色体: Chr02 坐标: 66378976-66379335 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004405`
名称	SmilChr02G004405
描述	LOB domain-containing protein 22-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	66378976 - 66379335 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009900`
GeneID	`131009900`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009900`
原始查询	`SmilChr02G004405`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LOB domain-containing protein 22-like
产物	LOB domain-containing protein 22-like
Arabidopsis	`AT3G13850` (LBD22) LOB domain-containing protein 22 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820598] identity=68.6; qcov=0.857; evalue=4.01e-45; confidence=medium
Rice	`Os08g0402100` - identity=69; qcov=0.706; evalue=7.83e-37; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03195 (LOB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009900

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793285.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793285.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793285.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793285.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793285.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:66379240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr2:66379248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr2:66379269`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B41,C28
`Chr2:66379269`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B41,C28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793285.1

119 aa

119

LOB

PF03195 LOB 37-118 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793285.1`	Pfam	`PF03195`	LOB	Family	37	118	7.5e-32	110.6	Lateral organ boundaries (LOB) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937302.1
ATGCAATCCAACAACATTTTCATGAACAGCAAAAGGATCACCGCCCCCACCGTCCCCAACAACCCCTCCTCCACCACCCACCGCCGCACCGCCTCCGCCTCCGCCCAAGCCTGCGCCGCCTGCAAGTACCAGCGCCGGAAGTGCGCCGCCGACTGCATCCTCGCCCCCTACTTCCCCCACGACCGCCAGCGGCAGTTCCTGAACGCCCACCGCCTCTTCGGTGTCAGCAACATCATCAAGATCGTCCGCCGCCTCGATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009900
ATGCAATCCAACAACATTTTCATGAACAGCAAAAGGATCACCGCCCCCACCGTCCCCAACAACCCCTCCTCCACCACCCACCGCCGCACCGCCTCCGCCTCCGCCCAAGCCTGCGCCGCCTGCAAGTACCAGCGCCGGAAGTGCGCCGCCGACTGCATCCTCGCCCCCTACTTCCCCCACGACCGCCAGCGGCAGTTCCTGAACGCCCACCGCCTCTTCGGTGTCAGCAACATCATCAAGATCGTCCGCCGCCTCGATCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793285.1
MQSNNIFMNSKRITAPTVPNNPSSTTHRRTASASAQACAACKYQRRKCAADCILAPYFPHDRQRQFLNAHRLFGVSNIIKIVRRLDPPAKDAAMRTIVFQSEARAVDPAGGCYRIIRDL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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