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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004407`

染色体: Chr02 坐标: 66390413-66392292 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004407`
名称	SmilChr02G004407
描述	LOB domain-containing protein 7-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	66390413 - 66392292 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013156`
GeneID	`131013156`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013156`
原始查询	`SmilChr02G004407`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LOB domain-containing protein 7-like
产物	LOB domain-containing protein 7-like
Arabidopsis	`AT3G13850` (LBD22) LOB domain-containing protein 22 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820598] identity=65.9; qcov=0.466; evalue=7.8e-52; confidence=medium
Rice	`Os08g0402100` - identity=69.8; qcov=0.383; evalue=2.1e-48; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03195 (LOB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013156

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797178.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797178.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797178.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797178.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057797178.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:66390612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr2:66390724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,C38
`Chr2:66390733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,C38
`Chr2:66390736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,C38
`Chr2:66390772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr2:66390880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B130,B36,B82,B86
`Chr2:66390998`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,B98
`Chr2:66391083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C31
`Chr2:66391222`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr2:66392042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797178.1

277 aa

138

277

LOB

PF03195 LOB 37-132 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797178.1`	Pfam	`PF03195`	LOB	Family	37	132	9.3e-35	119.9	Lateral organ boundaries (LOB) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941195.1
GAGGAACGCAAAAAATGAAGTCAAGCCTCAATTCAATCAAGAAACATAAATTCCCCTATCCTCATTCCCACCCCCGCCGCCGCCGGAGCCGCTCCCGCCACCGATATTTCACACACCACACACACTACACAATCTTATAAATAATCCGACATGCAATCCAACAACATTTTCATGAACAGCAAAAGGATCACCGCCCCCACCGGCCCCAACAACCCCTCCTCCACCACCCACCGCCGCACCGCCTCCGCCTCCGCCCAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013156
ATGCAATCCAACAACATTTTCATGAACAGCAAAAGGATCACCGCCCCCACCGGCCCCAACAACCCCTCCTCCACCACCCACCGCCGCACCGCCTCCGCCTCCGCCCAAGCCTGCGCCGCCTGCAAGTACCAGCGCCGGAAGTGCGCCGCCGACTGCATCCTCGCCCCCTACTTCCCCCACGACCGCCAGCGGCAGTTCCTGAACGCCCACCGCCTCTTCGGCGTCAGCAACATCATCAAGATCGTCCGCCGCCTCGATCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797178.1
MQSNNIFMNSKRITAPTGPNNPSSTTHRRTASASAQACAACKYQRRKCAADCILAPYFPHDRQRQFLNAHRLFGVSNIIKIVRRLDPPAKDAAMRTIVFQSEARAADPAGGCYRIIRDLEQQIELATAELEIVLHHLALCRAAAARQQDGGDANWRGNDAVVVDDGNSWSCIDGINNAHAESSSSSSFNLDHHHDQDLKIILDNLSRDDDHHHHGYKFDCHEEILPSNNGILTEENATSEEENGQFTYIQDENELQSAAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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