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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004413`

染色体: Chr02 坐标: 66485668-66486759 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004413`
名称	SmilChr02G004413
描述	PRA1 family protein F2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	66485668 - 66486759 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013164`
GeneID	`131013164`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013164`
原始查询	`SmilChr02G004413`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PRA1 family protein F2-like
产物	PRA1 family protein F2-like
Arabidopsis	`AT1G55190` (PRA7) PRA1 (Prenylated rab acceptor) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841962] identity=54.4; qcov=0.914; evalue=8.21e-59; confidence=high
Rice	`Os05g0200280` (P0708D12.1) - identity=46.9; qcov=1.04; evalue=4.7e-38; confidence=medium
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016192 (vesicle-mediated transport)
KEGG	-
Pfam	PF03208 (PRA1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013164

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057797193.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.60000	`XP_057797193.1`
3	Endosome	内体	0.60000	`XP_057797193.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057797193.1`
5	Endosome membrane	内体膜	0.40000	`XP_057797193.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:66486089`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	15	A6,B122,B124,B128,B5,B60,B63,B75,B83,B86,B99,C28,C30,C63,D2
`Chr2:66486099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr2:66486180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B21,B52
`Chr2:66486219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr2:66486304`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr2:66486443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:66486449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,C45,C83
`Chr2:66486480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,B60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797193.1

187 aa

187

PRA1

PF03208 PRA1 31-169 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797193.1`	Pfam	`PF03208`	PRA1	Family	31	169	3.7e-46	157.0	PRA1 family protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941210.1
TACAAGATTTGATAAGACTCAAGGATTTTAAGTTGAAAGAGTAAAGCCAGATTGAAACTATCTCGAAGCAACCAGAAACTAGGGGGCAGCACCAAATTCACACCTAAACTGCTCTGTTTCTTACACATAATTCAGTAGGTGCGGAGCCATGGATTCGTTTGCTGAAATATTTTTGTAACTGTTTTTCACTTTCTTCAAATTATTACTAGTAGTATTTTATTTCAGAAATCTAGTTGTGCTTTACGATAATATAATTTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013164
ATGTCTACCTACGGCACCATTCCTACGTTGTCATCCCCCACCGTGAAGCTCGACTACATCTCACTGGCCAGGGAGCGCCTCAACGCAGGCCTCGCTGCCTGCCGCCCGTGGCGGCAAATGTTCGACGTCCACCGCTTCGACCTACCCAAATCTGTAGCGGAGGCACGGGAGCGCGCCGCCGCCAATGCGGCGTACTTCCTCACGAACTACGCGATCTCTGCTCTCGCGATCCTCTTCCTCAGCCTCCTTTGGCACCCGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797193.1
MSTYGTIPTLSSPTVKLDYISLARERLNAGLAACRPWRQMFDVHRFDLPKSVAEARERAAANAAYFLTNYAISALAILFLSLLWHPISLMVFVAAMAAWLYLYFMRDEPLAVAGRTINDRTVLIGLSVSTIVVLLLTQAAGNIVAALMVAVVLVLIHGAVRTTDDLVSDAAETGGLWRSIDGQPSSH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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