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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004418`

染色体: Chr02 坐标: 66516765-66519571 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004418`
名称	SmilChr02G004418
描述	putative F-box/LRR-repeat protein At3g18150
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	66516765 - 66519571 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013169`
GeneID	`131013169`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013169`
原始查询	`SmilChr02G004418`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box/LRR-repeat protein At3g18150
产物	putative F-box/LRR-repeat protein At3g18150
Arabidopsis	`AT5G41830` (AT5G41830) RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834188] identity=25.7; qcov=0.367; evalue=5.36e-13; confidence=low
Rice	`Os08g0197500` (OsFbox425) - identity=28; qcov=0.437; evalue=3.49e-11; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013169

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797202.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797202.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797202.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797202.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057797202.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:66516922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,B91,C86
`Chr2:66517256`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr2:66517348`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B96,C20,C5
`Chr2:66517407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B94,B98,D4
`Chr2:66517675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B53,B71,C45
`Chr2:66517746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B71,C45
`Chr2:66517918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B56,B96,C20
`Chr2:66517924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:66517989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B53,B71,C45
`Chr2:66518050`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B118,B78,C27,C8
`Chr2:66518063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,C76
`Chr2:66518374`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797202.1

572 aa

286

572

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 170-310 aa PF24758 LRR_At5g56370 174-323 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 315-399 aa PF24758 LRR_At5g56370 321-390 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797202.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	170	310	6.9e-27	95.5	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057797202.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	174	323	1.3e-17	65.0	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats
`XP_057797202.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	315	399	6.9e-27	95.5	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057797202.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	321	390	1.3e-17	65.0	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941219.1
AAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAGAAAAAGCCATCTCAGAGTTAGTTTGGTACTGCTCCCAAATTATCGGTGGAAATAAAAATTGAATCTTCAGAAAATCGACGATGTGGCGGCGTAGAATGCTTTTTCAATCGCGTCTTCCTAGGGTTCCCGACGCCATTACTCCACCAGAGCCCGGTCGTAGCGACGATCGCGAGTTGGGGAAGAAGAAGACGAGGAAGAAGCGAAGAAATACGGATTTGAATACTGATAAAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013169
ATGTGGCGGCGTAGAATGCTTTTTCAATCGCGTCTTCCTAGGGTTCCCGACGCCATTACTCCACCAGAGCCCGGTCGTAGCGACGATCGCGAGTTGGGGAAGAAGAAGACGAGGAAGAAGCGAAGAAATACGGATTTGAATACTGATAAAATCAGAAAGATGCGAAAGATCGCCGGAGAAGACGAAGTATTGGATCGGATATCGGAGCTGCCGGACTCGATCATCCACCACATCCTCAATTTCCTCCGCTGCACCAAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797202.1
MWRRRMLFQSRLPRVPDAITPPEPGRSDDRELGKKKTRKKRRNTDLNTDKIRKMRKIAGEDEVLDRISELPDSIIHHILNFLRCTKDVARTTVLSKNWKRVFDSYQSFHFDQRWFRMRKEVGFFDLETAGKKRYEEWDNFKGYVGNSLATRLDRLQCVDKFRLFAYGVDIQCIAGWIRAAIAKNVKELDVHVETCRNDALPINLTQSSSITFLKLTGHAMYSLASMKMCNLRGISIKEARYFDVNLMKKLEDNCPLLEDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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