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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004434`

染色体: Chr02 坐标: 66729661-66732153 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004434`
名称	SmilChr02G004434
描述	ankyrin repeat-containing protein At5g02620-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	66729661 - 66732153 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009903`
GeneID	`131009903`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009903`
原始查询	`SmilChr02G004434`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ankyrin repeat-containing protein At5g02620-like
产物	ankyrin repeat-containing protein At5g02620-like
Arabidopsis	`AT5G35810` (AT5G35810) Ankyrin repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833567] identity=33.6; qcov=0.721; evalue=8.71e-46; confidence=low
Rice	`Os11g0251200` - identity=21.8; qcov=0.934; evalue=4.61e-12; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF12796 (Ank_2); PF13637 (Ank_4); PF13962 (PGG)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009903

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057793286.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793286.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793286.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793286.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793286.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:66730050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:66730099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr2:66730134`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B63,B83
`Chr2:66730134`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B63,B83
`Chr2:66730174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr2:66730236`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	23	A23,A6,A7,A8,B100,B112,B114,B115,B121,B17,B38,B39,B62,B71,B85,C11,C46,C52,C61,C62,C69,C80,D5
`Chr2:66730288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,B53,C37
`Chr2:66730314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:66730361`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	127	A1,A13,A14,A16,A23,A24,A25,A5,A6,A7,A8,B10,B100,B101,B107,B108,B111,B112,B113,B115,B121,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B133,B135,B136,B137,B139,B14,B17,B19,B2,B20,B24,B28,B3,B31,B32,B35,B36,B38,B40,B46,B5,B50,B53,B54,B55,B56,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B66,B68,B69,B71,B72,B74,B75,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B9,B94,B96,B97,B99,C10,C11,C13,C15,C16,C18,C19,C23,C27,C28,C3,C31,C33,C36,C37,C4,C46,C47,C49,C52,C53,C54,C56,C57,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C65,C67,C69,C7,C71,C74,C75,C80,C83,C85,C86,C87,D1,D10,D2,D5,D7
`Chr2:66730364`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A18,A21,B130,B137,B45,B47,C4,C85,D6
`Chr2:66730365`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	123	A1,A13,A14,A16,A23,A24,A25,A5,A6,A7,A8,B10,B100,B101,B107,B108,B111,B112,B113,B115,B121,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B133,B135,B136,B139,B14,B17,B19,B2,B20,B24,B28,B3,B31,B32,B35,B36,B38,B40,B46,B5,B50,B53,B54,B55,B56,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B66,B68,B69,B71,B72,B74,B75,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B9,B94,B96,B97,B99,C10,C11,C13,C15,C16,C18,C19,C23,C27,C28,C3,C31,C33,C36,C37,C46,C47,C49,C52,C53,C54,C56,C57,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C65,C67,C69,C7,C71,C74,C75,C80,C83,C86,C87,D1,D10,D2,D5,D7
`Chr2:66730404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793286.1

441 aa

220

441

Ank_2

Ank_4

PGG

PF12796 Ank_2 5-69 aa PF13637 Ank_4 13-63 aa PF13962 PGG 284-393 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793286.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	5	69	1.1e-12	49.1	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057793286.1`	Pfam	`PF13637`	Ank_4	Repeat	13	63	5.5e-09	36.8	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057793286.1`	Pfam	`PF13962`	PGG	Domain	284	393	7.6e-16	58.7	Domain of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937303.1
ATGTTAGAGTTGTGCGATGCTAATGGCTACACAGCATGTTGCTATGCTGCAATGGCTGGTAATCTTGAACTGCTTCGTATAATGATGGAGGCCAATCCATTCATTGCCAATGTACGGAATGGGTATGGGACGACGGCGTTTGAGCTTGCAATTTCCTATGGAAACGCACAAATACTTGCGTATTTTCTAAAGGAAATTGAGATAAAAGATGTGGCTTTGATGATACTGGAAAACAAAGGAAATCTGGCGATAAAGCAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009903
ATGTTAGAGTTGTGCGATGCTAATGGCTACACAGCATGTTGCTATGCTGCAATGGCTGGTAATCTTGAACTGCTTCGTATAATGATGGAGGCCAATCCATTCATTGCCAATGTACGGAATGGGTATGGGACGACGGCGTTTGAGCTTGCAATTTCCTATGGAAACGCACAAATACTTGCGTATTTTCTAAAGGAAATTGAGATAAAAGATGTGGCTTTGATGATACTGGAAAACAAAGGAAATCTGGCGATAAAGCAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793286.1
MLELCDANGYTACCYAAMAGNLELLRIMMEANPFIANVRNGYGTTAFELAISYGNAQILAYFLKEIEIKDVALMILENKGNLAIKQDDDNRTALHVLAQLDISSGEDGKGQFCVGVLAKKLWDNIQNSGTKTVVELMKNPPILHDAAKVGNLDIIEMITFDYPHLLSHVDPHGYSIFHILVMHRIPSTLKLISKVRNVKKFDALVQDKDGNNLLHSTGTSIHPGHLEIVLEPDVQMQRALAWFKAVEEIVPPFYREMRNI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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