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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004453`

染色体: Chr02 坐标: 66908101-66911425 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004453`
名称	SmilChr02G004453
描述	wall-associated receptor kinase-like 1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	66908101 - 66911425 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013201`
GeneID	`131013201`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013201`
原始查询	`SmilChr02G004453`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	wall-associated receptor kinase-like 1
产物	wall-associated receptor kinase-like 1
Arabidopsis	`AT1G21270` (WAK2) wall-associated kinase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838723] identity=39; qcov=0.952; evalue=1.19e-159; confidence=medium
Rice	`Os04g0598900` (OsWAK50) - identity=41.9; qcov=0.935; evalue=5.06e-159; confidence=medium
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0007166 (cell surface receptor signaling pathway); GO:0030247 (polysaccharide binding)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07645 (EGF_CA); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF12947 (EGF_3); PF13947 (GUB_WAK_bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013201

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797250.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797250.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797250.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797250.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797250.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:66908151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B73,C78
`Chr2:66908155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B73,C78
`Chr2:66908260`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B73,C78
`Chr2:66908398`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr2:66908416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr2:66908467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr2:66908495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:66908497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:66908557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B99
`Chr2:66908573`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B14
`Chr2:66908573`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B14
`Chr2:66908641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C78,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797250.1

753 aa

376

753

GUB_WAK_bind

EGF_CA

EGF_3

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF13947 GUB_WAK_bind 26-87 aa PF07645 EGF_CA 308-339 aa PF12947 EGF_3 314-343 aa PF00069 Pkinase 432-698 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 436-701 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797250.1`	Pfam	`PF13947`	GUB_WAK_bind	Domain	26	87	6.2e-10	40.0	Wall-associated receptor kinase galacturonan-binding
`XP_057797250.1`	Pfam	`PF07645`	EGF_CA	Domain	308	339	8.8e-07	29.8	Calcium-binding EGF domain
`XP_057797250.1`	Pfam	`PF12947`	EGF_3	Domain	314	343	1.9e-07	31.9	EGF domain
`XP_057797250.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	432	698	5.5e-48	164.4	Protein kinase domain
`XP_057797250.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	436	701	1.2e-48	166.4	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941267.1
GTACAATCATAACATGTACGTAGCTTGATAGTTACTTACCGTGATCCTTATTATAAATATATGTTTCGAAATTGGGATGTATATATGAATTATCATACTACTCTTGAGCATCGCGTTAATTAATTAAAATTCAAATGAGTTGTCTTCTGCACTTCATCTTCTTCCTCCTTCTTCTTCTTCTTCCACTAGCATCAAGCTACGGATCCGGTTGCCCTACCCAATGTGGAAAGGTAAAGATTCAATATCCATTTGGAGTTGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013201
ATGAGTTGTCTTCTGCACTTCATCTTCTTCCTCCTTCTTCTTCTTCTTCCACTAGCATCAAGCTACGGATCCGGTTGCCCTACCCAATGTGGAAAGGTAAAGATTCAATATCCATTTGGAGTTGGGTCGGGTTGCTCTATGGAGGCATCGTTTAACATCACTTGCAACACTTCCACGGCTCCTCCCAAACCATACCTCAACATTAGTGATGAGAAGATAGAAGTGGTTGAAATAAGAGTTGATAACCCGGCCTATATCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797250.1
MSCLLHFIFFLLLLLLPLASSYGSGCPTQCGKVKIQYPFGVGSGCSMEASFNITCNTSTAPPKPYLNISDEKIEVVEIRVDNPAYIRIKYPYLLWGVCYHTPSGNMTWTDGSGGISLRDTQYTLSEYNWLIAIGCDDALTASTYKGQGKQTFRDGCIGICFDDHGSSGSCPKNGDGNSGGDGCCRSPIPKGASTLSAGLTDLSKSWKSVRVFPCSYAFLMEKGSPNGSGYSYNYSILKQKSTDFINNDEMVVRLDWRAGN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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