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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004464`

染色体: Chr02 坐标: 67058475-67063551 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004464`
名称	SmilChr02G004464
描述	uncharacterized SmilChr02G004464
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	67058475 - 67063551 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007750`
GeneID	`131007750`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007750`
原始查询	`SmilChr02G004464`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0482100; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0482100; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G06220` (AT5G06220) LETM1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830509] identity=27.2; qcov=0.698; evalue=8.27e-43; confidence=low
Rice	`Os08g0482100` - identity=30.1; qcov=0.595; evalue=1.49e-43; confidence=low
GO	GO:0005743 (mitochondrial inner membrane); GO:0030003 (intracellular monoatomic cation homeostasis); GO:0043022 (ribosome binding)
KEGG	-
Pfam	PF07766 (LETM1_RBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007750

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057790636.1`
2	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057790637.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790636.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790636.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790636.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:67059747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B130,B137
`Chr2:67059792`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C54
`Chr2:67059792`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C54
`Chr2:67059795`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C54
`Chr2:67059795`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C54
`Chr2:67059809`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	39	A14,A20,A22,A8,B102,B106,B119,B129,B22,B58,B61,B65,B67,B69,B73,B74,B78,B79,B9,B99,C1,C15,C17,C18,C19,C22,C23,C29,C38,C43,C5,C55,C56,C58,C6,C63,C65,C86,C87
`Chr2:67059826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B75,B95,C14
`Chr2:67059852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B114,C74
`Chr2:67059852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,C74
`Chr2:67060698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,C86
`Chr2:67060699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr2:67060823`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790636.1

700 aa

350

700

LETM1_RBD

PF07766 LETM1_RBD 614-684 aa

XP_057790637.1

699 aa

350

699

LETM1_RBD

PF07766 LETM1_RBD 613-683 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790636.1`	Pfam	`PF07766`	LETM1_RBD	Domain	614	684	8.3e-07	29.5	LETM1-like, RBD
`XP_057790637.1`	Pfam	`PF07766`	LETM1_RBD	Domain	613	683	8.3e-07	29.5	LETM1-like, RBD

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934654.1
GTATATCACAATGAATATTTTCAACATGAATTTACCTTATCTAATTCTCAATTTGATGTTATCTTATTTCTGCTTCGATGTTTTCAATTAAAGTTCGGTTGTATTATATAAAGCCCACCAACACCATTTTTCTTTCTCTTTTTGCTATTTTGTTGTTTCAATGGCTTTAAGCTTCACACTGCGCTGCAACCTGCAAAGAAGTGCATTATCAGAGGAGAGATTGAAGATGAGGACTAGTGCACTGCATCTCAACAACAATA...

XM_057934653.1
ACAACAATGCTTTGTTCATAGTTAATAAGAATAACTTTTACATTTAAATCGCCCTGTGTGTGAGAGAGTAGAAATGTGTGCGTTTATGAATTTTTCTCTAAAAAAGTAAATTGTTAGTCTTTTTGGATTCAGGCAGTGCAAAGCGAATTTTGAGAATTTCCTCCAAATGCGACACTTTGAAAGAAACGAATTTGTTGTAAATTTAAGAAGTGCATTATCAGAGGAGAGATTGAAGATGAGGACTAGTGCACTGCATCTCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131007750
ATGGCTTTAAGCTTCACACTGCGCTGCAACCTGCAAAGAAGTGCATTATCAGAGGAGAGATTGAAGATGAGGACTAGTGCACTGCATCTCAACAACAATATCAATGTCCTTAAAAACCAACTTGTGTCAAGACAATTCCTCTTGAAGCATGGATCCACGTCACCCTTCCAGCATGGCGCGCTGTCATCATCCTCATTGGCTGCCGACTCCAGCCAGAGTGGCTTGGAGGAGCATTCTTTGTTGACTAATGATGTGAAGTT...

LOC131007750
ATGCGACACTTTGAAAGAAACGAATTTGTTGTAAATTTAAGAAGTGCATTATCAGAGGAGAGATTGAAGATGAGGACTAGTGCACTGCATCTCAACAACAATATCAATGTCCTTAAAAACCAACTTGTGTCAAGACAATTCCTCTTGAAGCATGGATCCACGTCACCCTTCCAGCATGGCGCGCTGTCATCATCCTCATTGGCTGCCGACTCCAGCCAGAGTGGCTTGGAGGAGCATTCTTTGTTGACTAATGATGTGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057790636.1
MRHFERNEFVVNLRSALSEERLKMRTSALHLNNNINVLKNQLVSRQFLLKHGSTSPFQHGALSSSSLAADSSQSGLEEHSLLTNDVKFNRVNCLVWLLHESARSFSAAVKSLGLGGAGPPLAMAWIGVDVHAWHKHISYQVAVYALLMAVTEVELFLSHNRSSNPSPVLNILSPKANFLGDLIDSQLNTRDPKLVQWFRMVELPRISGSFMALFKKWTMEYAGSGVAGTAMAMTCCACIQKLGSERISCCLFSDSIGDAL...

XP_057790637.1
MALSFTLRCNLQRSALSEERLKMRTSALHLNNNINVLKNQLVSRQFLLKHGSTSPFQHGALSSSSLAADSSQSGLEEHSLLTNDVKFNRVNCLVWLLHESARSFSAAVKSLGLGGAGPPLAMAWIGVDVHAWHKHISYQVAVYALLMAVTEVELFLSHNRSSNPSPVLNILSPKANFLGDLIDSQLNTRDPKLVQWFRMVELPRISGSFMALFKKWTMEYAGSGVAGTAMAMTCCACIQKLGSERISCCLFSDSIGDALF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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