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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004510`

染色体: Chr02 坐标: 67626395-67631109 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004510`
名称	SmilChr02G004510
描述	KIN17-like protein
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	67626395 - 67631109 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007608`
GeneID	`131007608`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007608`
原始查询	`SmilChr02G004510`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	KIN17-like protein
产物	KIN17-like protein
Arabidopsis	`AT1G55460` (AT1G55460) DNA/RNA-binding protein Kin17, conserved region [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841993] identity=70.3; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0570300` (KIN17) - identity=63.2; qcov=1.08; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006260 (DNA replication); GO:0006974 (DNA damage response)
KEGG	-
Pfam	PF10357 (WH_KIN17); PF18131 (KN17_SH3); PF25092 (SH3_KIN17_C); PF25095 (C2H2-zf_KIN17)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007608

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790502.1`
2	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057790502.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057790502.1`
4	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057790502.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790502.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:67626717`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B1,B65,C8
`Chr2:67627032`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B48
`Chr2:67627032`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B48
`Chr2:67627056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr2:67627071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr2:67627098`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr2:67627368`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B1,B65,C8
`Chr2:67627369`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr2:67627422`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B1,B65,C8
`Chr2:67627438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B93,C2
`Chr2:67627583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:67627584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790502.1

397 aa

198

397

C2H2-zf_KIN17

WH_KIN17

KN17_SH3

SH3_KIN17_C

PF25095 C2H2-zf_KIN17 24-53 aa PF10357 WH_KIN17 59-177 aa PF18131 KN17_SH3 279-332 aa PF25092 SH3_KIN17_C 341-397 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790502.1`	Pfam	`PF25095`	C2H2-zf_KIN17	Domain	24	53	1.6e-20	73.7	KIN17 C2H2-type zinc finger domain
`XP_057790502.1`	Pfam	`PF10357`	WH_KIN17	Domain	59	177	4.2e-45	153.2	KIN17 WH-like domain
`XP_057790502.1`	Pfam	`PF18131`	KN17_SH3	Domain	279	332	4.1e-22	78.7	KN17 SH3-like domain
`XP_057790502.1`	Pfam	`PF25092`	SH3_KIN17_C	Domain	341	397	6.8e-24	84.8	KIN17 C-terminal SH3 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934519.1
ATTTCTTTATTTTCTTGAATAAGTTATCAAAAAAAAAAAAGTATACGTTCAACAAAACTGAAAAAAATTGCAATAAAATCCTATACTATCGTCTCAAAAATTTTGAAGGTGTTCCCATTTTATGGTTATAATAATTGTTGGATTTATGAGAAGGATGTCGTCGATAATGGCAGTCATATAGTATTAGATATTGCTATCATTGTTGGAACCCCCAATTCACAAACCCTAAACTACTAAAATCCCTATAATTCGGCAACCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007608
ATGGGGAAGAACGAATTCCTAACCCCAAAGGCGATCGCGAACCGGATCAAGGCAAAAGGTCTGCAGAAGCTGCGATGGTACTGCCAGATGTGCCAAAAGCAATGCCGCGACGAGAACGGATTCAAATGCCATTGTATGAGCGAATCGCACCAACGCCAGATGCAGGTCTTCGGCCAGAACCCCACACGAATCATCAGCGGCTACTCCGAGGAGTTCGAGACCATGTTCCTCGAGCACATGAAGCGGAGCCACCGCTTCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790502.1
MGKNEFLTPKAIANRIKAKGLQKLRWYCQMCQKQCRDENGFKCHCMSESHQRQMQVFGQNPTRIISGYSEEFETMFLEHMKRSHRFSRIAATVVYNEYIADRNHVHMNSTQWATLTEFIKYLGKTGKCKVEETPKGWFITYIDNDSETLFKERMKNKRLKADMVEEEKMEREIQKQIERAEQMMGSDKGGEEEGIAKSRMLEKNDEEGGAKIKLSLGQSKKNAEMNGKRGDSTKMLFDEVEPESISGKRRREGEGSSKNA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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