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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004511`

染色体: Chr02 坐标: 67638530-67639830 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004511`
名称	SmilChr02G004511
描述	deSI-like protein At4g17486
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	67638530 - 67639830 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011165`
GeneID	`131011165`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011165`
原始查询	`SmilChr02G004511`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	deSI-like protein At4g17486
产物	deSI-like protein At4g17486
Arabidopsis	`AT1G80690` (AT1G80690) PPPDE putative thiol peptidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844408] identity=67; qcov=0.836; evalue=2.84e-88; confidence=high
Rice	`Os03g0198500` - identity=56.5; qcov=0.794; evalue=1.05e-70; confidence=high
GO	GO:0016579 (protein deubiquitination); GO:0101005 (deubiquitinase activity)
KEGG	-
Pfam	PF05903 (Peptidase_C97)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011165

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057794946.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057794946.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794946.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794946.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794946.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:67638710`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	45	A11,A14,A15,A20,A21,A22,A3,A8,B102,B103,B127,B130,B132,B136,B29,B33,B37,B54,B55,B56,B58,B61,B65,B74,B79,B93,B96,C13,C18,C2,C20,C24,C28,C29,C33,C41,C43,C47,C57,C6,C69,C73,C74,C8,C87
`Chr2:67638755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794946.1

214 aa

107

214

Peptidase_C97

PF05903 Peptidase_C97 16-150 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794946.1`	Pfam	`PF05903`	Peptidase_C97	Domain	16	150	2.5e-50	171.0	PPPDE putative peptidase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938963.1
TACCGTACTCCAAAAAATGTGTTATAATTATACCAATAAACACACCCACTTCACCTCATCATGAGTTTACGTTACTTTCCCCCATAATACAAATGTTCTCTACGAAAAAAAATAAAAAATAACATAACTACAGCTCAGATTCCCATCAATCACCAATAAACTTTAGCCCCATATTTTCCCCACACATTTAATTTATATGCTCCCCTAATTCGCCAAATTTTGACACTGCGGCAACTCTTATGCCGTCTCTCTCTCTCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011165
ATGTTATGCAGGAAAAGTTCAGTGAAAAGTAGGCGTGGATCGATGGCTGTGAATCTAAATGTGTATGATCTAACCTCAATGAATGGCTATGCCTACTGGCTTGGACTTGGGGTCTACCATTCTGGTGTTCAAGTTGATGGAGTGGAGTATGCATTTGGAGCTCATGAATATCCGACAACTGGGATATTCGAAGGCCACCCAAAGCAATGCGATGGCTTCACATTTCGGAAATCTATTCTGATAGGCTATACCGATATGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794946.1
MLCRKSSVKSRRGSMAVNLNVYDLTSMNGYAYWLGLGVYHSGVQVDGVEYAFGAHEYPTTGIFEGHPKQCDGFTFRKSILIGYTDMSPGEVRALMEDFSSKYKGNAYNLITKNCNHFCNDACLRLTGSPIPSWVNRLARIGSLCHCIIPTNLNSTKVGVGHHKVEDNMEKKKLRSRCNSFSTSSSNSSSSPPLAATIRGRTSLPSHFVINSIAN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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