当前解析结果
SmilChr02G004513| 统一新 Gene ID | SmilChr02G004513 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G004513 |
| 描述 | zinc finger protein 7-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 67664369 - 67664731 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131009913 |
|---|---|
| GeneID | 131009913 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009913 |
| 原始查询 | SmilChr02G004513 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | zinc finger protein 7-like |
| 产物 | zinc finger protein 7-like |
| Arabidopsis | AT1G80730 (ZFP1)zinc-finger protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844412] identity=96.5; qcov=0.242; evalue=3.5e-14; confidence=weak |
| Rice | Os03g0607700- identity=76.3; qcov=0.317; evalue=3.24e-14; confidence=low |
| GO | GO:0009788 (negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009913 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057793296.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057793296.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057793296.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057793296.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057793296.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:67664475 |
TAG |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 20 | B106,B110,B125,B129,B22,B40,B52,B60,B79,B99,C1,C19,C22,C29,C43,C48,C5,C55,C58,C65 |
Chr2:67664582 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C7 |
Chr2:67664727 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 132 | A10,A11,A13,A15,A18,A19,A22,A24,A25,A6,B100,B104,B106,B110,B111,B112,B114,B117,B118,B12,B120,B124,B125,B126,B128,B129,B133,B137,B138,B140,B15,B17,B19,B22,B23,B26,B28,B3,B30,B33,B35,B37,B38,B40,B41,B45,B46,B47,B48,B5,B52,B56,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B67,B68,B69,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B81,B86,B89,B9,B92,B93,B94,B96,B98,B99,C1,C14,C15,C19,C2,C21,C22,C27,C28,C29,C30,C31,C33,C35,C36,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C46,C48,C5,C52,C54,C55,C57,C58,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C70,C71,C73,C74,C76,C77,C79,C80,C81,C82,C86,C87,D10,D11,D2,D6,D8 |
Chr2:67664730 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 135 | A10,A11,A13,A15,A18,A19,A22,A24,A25,A6,B100,B104,B106,B11,B110,B111,B112,B114,B117,B118,B12,B120,B124,B125,B126,B128,B129,B133,B137,B138,B140,B15,B17,B19,B22,B23,B26,B28,B3,B30,B31,B33,B35,B37,B40,B41,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B52,B56,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B67,B68,B69,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B81,B86,B89,B9,B92,B93,B94,B96,B98,B99,C1,C14,C15,C19,C2,C21,C22,C27,C28,C29,C30,C31,C33,C35,C36,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C46,C48,C5,C52,C54,C55,C57,C58,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C7,C70,C71,C73,C74,C76,C77,C79,C80,C81,C82,C86,C87,D10,D11,D2,D6,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。