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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004537`

染色体: Chr02 坐标: 67957432-67961793 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004537`
名称	SmilChr02G004537
描述	mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	67957432 - 67961793 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008533`
GeneID	`131008533`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008533`
原始查询	`SmilChr02G004537`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20-like
产物	mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20-like
Arabidopsis	`AT5G67080` (MAPKKK19) mitogen-activated protein kinase kinase kinase 19 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836843] identity=42.7; qcov=0.865; evalue=2.19e-62; confidence=medium
Rice	`Os02g0322400` - identity=32.9; qcov=0.877; evalue=1.86e-42; confidence=low
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008533

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791423.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057791423.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057791423.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791423.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791423.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:67960948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:67961181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr2:67961439`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B93,C2
`Chr2:67961439`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B93,C2
`Chr2:67961488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,A5
`Chr2:67961511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B14,B140,B81,C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791423.1

333 aa

166

333

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 22-276 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 23-236 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791423.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	22	276	4.3e-44	151.6	Protein kinase domain
`XP_057791423.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	23	236	8.7e-23	81.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935440.1
ATGTCCGGAGAGGGAGAGGAAGAAGCCGTCAATTCATACGGAGATGGAATTGCATGGATTAGGGCGTCAATGATCGGAAGAGGGAGTTTTGGGCGTGTTTATCTCGCAACTCTCAGAAACCCCACATCCAAAAGCAGCTCTCTGCCGCCGCTGATGGCTGTAAAATCTGCCGAGGTTTCCTCCTCGGGCTCGCTTCAGAAGGAGAAGGAGGTTTACTGCAATTTGGAAAGGAGCCCTTACATAATCCAGTGTTACGGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008533
ATGTCCGGAGAGGGAGAGGAAGAAGCCGTCAATTCATACGGAGATGGAATTGCATGGATTAGGGCGTCAATGATCGGAAGAGGGAGTTTTGGGCGTGTTTATCTCGCAACTCTCAGAAACCCCACATCCAAAAGCAGCTCTCTGCCGCCGCTGATGGCTGTAAAATCTGCCGAGGTTTCCTCCTCGGGCTCGCTTCAGAAGGAGAAGGAGGTTTACTGCAATTTGGAAAGGAGCCCTTACATAATCCAGTGTTACGGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791423.1
MSGEGEEEAVNSYGDGIAWIRASMIGRGSFGRVYLATLRNPTSKSSSLPPLMAVKSAEVSSSGSLQKEKEVYCNLERSPYIIQCYGDEITIGRSGTMAFNLMLEYASGGTLADRIGESGGNGLAELEVKLHTRSILRGLRHIHELGYVHCDMKPHNILLVPNAAGGIRAKIGDLGLARRVTKKRKLGVCWEGTRMYLSPEAVTDHVQEAPSDVWAVGCIVLEMLTGKSPLEGKKEITGLKIPNGVSKEARAFLKGCFVRN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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