当前解析结果
SmilChr02G004540| 统一新 Gene ID | SmilChr02G004540 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G004540 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G004540 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 67966612 - 67972355 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008535 |
|---|---|
| GeneID | 131008535 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008535 |
| 原始查询 | SmilChr02G004540 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008535 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057791425.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791425.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791425.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057791425.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057791425.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:67967034 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D6 |
Chr2:67967082 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr2:67968563 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B94,B98 |
Chr2:67969419 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C47,D6 |
Chr2:67969483 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B94,B98 |
Chr2:67969854 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B127 |
Chr2:67970024 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B20,C44,C64,C66 |
Chr2:67970027 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C47,D6 |
Chr2:67970512 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A21,B44 |
Chr2:67970790 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B84,D11 |
Chr2:67970877 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C86 |
Chr2:67971042 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C47 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。