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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004541`

染色体: Chr02 坐标: 67977113-67979701 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004541`
名称	SmilChr02G004541
描述	floricaula protein
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	67977113 - 67979701 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008536`
GeneID	`131008536`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008536`
原始查询	`SmilChr02G004541`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	floricaula protein
产物	floricaula protein
Arabidopsis	`AT5G61850` (LFY) floral meristem identity control protein LEAFY (LFY) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836307] identity=64.3; qcov=1.03; evalue=2.71e-165; confidence=high
Rice	`Os04g0598300` (RFL) - identity=59.1; qcov=0.88; evalue=2.08e-133; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF01698 (SAM_LFY); PF17538 (C_LFY_FLO)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008536

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791428.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791428.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791428.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791428.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791428.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:67977270`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C64,C66
`Chr2:67977270`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr2:67977298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr2:67978928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,C5
`Chr2:67979256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B8,C77
`Chr2:67979269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr2:67979487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:67979524`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:67979550`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791428.1

392 aa

196

392

SAM_LFY

C_LFY_FLO

PF01698 SAM_LFY 45-123 aa PF17538 C_LFY_FLO 212-377 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791428.1`	Pfam	`PF01698`	SAM_LFY	Domain	45	123	9.4e-44	148.1	Floricaula / Leafy protein SAM domain
`XP_057791428.1`	Pfam	`PF17538`	C_LFY_FLO	Domain	212	377	2.1e-111	369.9	DNA Binding Domain (C-terminal) Leafy/Floricaula

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935445.1
AAGGGCAGCCCTTCTCCCCAACCACAAACCTCCAACCATATCCATCACTACCAAACAAACTTTTTTGAGTGGAAATATGGATCCTGATGCCTTCTCAGCGAGCTTGTTCAAGTGGGACCCTCGGGCCGGGCTGGCGCCCCCGAACCGGCTGCTGGAGGCGGTGGTGCCGCCTCCTCCCCCGGCCCCCGCGGCCTACTCGATGAGGCCGCGCGAGCTGGGGGGCTTGGAGGAGCTCTTCCAAGCATACGGCATAAGGTATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008536
ATGGATCCTGATGCCTTCTCAGCGAGCTTGTTCAAGTGGGACCCTCGGGCCGGGCTGGCGCCCCCGAACCGGCTGCTGGAGGCGGTGGTGCCGCCTCCTCCCCCGGCCCCCGCGGCCTACTCGATGAGGCCGCGCGAGCTGGGGGGCTTGGAGGAGCTCTTCCAAGCATACGGCATAAGGTATTTCACCGCCGCCAAGATCGCTGAGCTGGGATTCACGGTGAACACGCTCTTGGACATGAGAGATGAGGAGCTTGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791428.1
MDPDAFSASLFKWDPRAGLAPPNRLLEAVVPPPPPAPAAYSMRPRELGGLEELFQAYGIRYFTAAKIAELGFTVNTLLDMRDEELDEMMNSLCQIFRWDLLVGERYGIKAAVRAERRRLDEEDARRRHLLSGDASHALDALSQEGLSEEPVQQEKEAAGSGGGGVWEMVVANGRKQRRRKSSCKGRSRMASMEEEEEDDDETEGAEDDENCGGGGNERQREHPFIVTEPGEVARGKKNGLDYLFHLYEQCREFLIQVQNI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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