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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004544`

染色体: Chr02 坐标: 67993430-68001886 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004544`
名称	SmilChr02G004544
描述	uncharacterized SmilChr02G004544
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	67993430 - 68001886 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008540`
GeneID	`131008540`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008540`
原始查询	`SmilChr02G004544`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839231]; symbol=AT1G01630; hit=AT1G01630; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839231]; symbol=AT1G01630; hit=AT1G01630; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G01630` (AT1G01630) Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839231] identity=60.2; qcov=0.953; evalue=3.19e-99; confidence=high
Rice	`Os01g0926800` (P0482D04.19) - identity=53.1; qcov=0.901; evalue=1.29e-78; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00650 (CRAL_TRIO); PF03765 (CRAL_TRIO_N); PF13716 (CRAL_TRIO_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008540

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057791432.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057791432.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057791434.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791432.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791432.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:67993667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,C5
`Chr2:67993848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C5,C8
`Chr2:67994415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr2:67994550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791432.1

250 aa

125

250

CRAL_TRIO_N

CRAL_TRIO

CRAL_TRIO_2

PF03765 CRAL_TRIO_N 19-68 aa PF00650 CRAL_TRIO 94-240 aa PF13716 CRAL_TRIO_2 105-242 aa

XP_057791434.1

232 aa

116

232

CRAL_TRIO_N

CRAL_TRIO

CRAL_TRIO_2

PF03765 CRAL_TRIO_N 21-50 aa PF00650 CRAL_TRIO 76-222 aa PF13716 CRAL_TRIO_2 87-224 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791432.1`	Pfam	`PF03765`	CRAL_TRIO_N	Domain	19	68	2.9e-07	31.3	CRAL/TRIO, N-terminal domain
`XP_057791432.1`	Pfam	`PF00650`	CRAL_TRIO	Domain	94	240	9.5e-37	126.9	CRAL/TRIO domain
`XP_057791432.1`	Pfam	`PF13716`	CRAL_TRIO_2	Domain	105	242	5e-11	43.8	Divergent CRAL/TRIO domain
`XP_057791434.1`	Pfam	`PF03765`	CRAL_TRIO_N	Domain	21	50	8e-07	29.8	CRAL/TRIO, N-terminal domain
`XP_057791434.1`	Pfam	`PF00650`	CRAL_TRIO	Domain	76	222	8.2e-37	127.1	CRAL/TRIO domain
`XP_057791434.1`	Pfam	`PF13716`	CRAL_TRIO_2	Domain	87	224	4e-11	44.1	Divergent CRAL/TRIO domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935449.1
ATATAATTTTAAAAAAGAGTACAGTAGATGTGTTGTTGTAATAATGACAAAGCCATTAAATTGTGCAACTGCACCTTGGGTCAGCCTCCGTGTGTTGTTCATGTATATATTGATTTGGTGCTCTCAATAGGGACTAGCTCTTAAATATAGTACCTATTTTGTGGGTAAATTTTACGACTTAGCAACAACATTTCCTCTTCCTTATAAATACATAGAGGCCAGAATTAATTATATGGTATGGCGTATGCGATGGAAGACGA...

XM_057935451.1
AAATATAGTACCTATTTTGTGGGTAAATTTTACGACTTAGCAACAACATTTCCTCTTCCTTATAAATACATAGAGGCCAGAATTAATTATATGGTATGGCGTATGCGATGGAAGACGACGAAGATATTTTTCACTCTCCAGAAAAAATAATGGAAGAGAGAGATGATGAAGACGAAAAGAAGAAGCTTCAGCTTATGCGAGCCAACCCCTCCTGCAAGTTTGACATGGCAGGATGTAGATGAGCCAACTCTGAGAAGGTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131008540
ATGGCGTATGCGATGGAAGACGACGAAGATATTTTTCACTCTCCAGAAAAAATAATGGAAGAGAGAGATGATGAAGACGAAAAGAAGAAGCTTCAGCTTATGCGAGCCAACCCCTCCTGCAAGGATGTAGATGAGCCAACTCTGAGAAGGTTTCTTCGCGCTCGAGATCTCGACGTGGAGAAAGCATCTGCAATGCTAGTCAAGTGCTTAACCTGGAGACGAACCTTTGTTCCCAAGGGTTTCGTTTCAGAATCGGAGGT...

LOC131008540
ATGATGAAGACGAAAAGAAGAAGCTTCAGCTTATGCGAGCCAACCCCTCCTGCAAGTTTGACATGGCAGGATGTAGATGAGCCAACTCTGAGAAGGTTTCTTCGCGCTCGAGATCTCGACGTGGAGAAAGCATCTGCAATGCTAGTCAAGTGCTTAACCTGGAGACGAACCTTTGTTCCCAAGGGTTTCGTTTCAGAATCGGAGGTGCCAAATGAGATAGCTCAGAACAAGATGTTTCTACAAGGAACAGACAAGAAAGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057791432.1
MAYAMEDDEDIFHSPEKIMEERDDEDEKKKLQLMRANPSCKDVDEPTLRRFLRARDLDVEKASAMLVKCLTWRRTFVPKGFVSESEVPNEIAQNKMFLQGTDKKGHPISVVFGSRHFSRKGGLDEFRRFLVFALDKLCQRIPDEVEKFTIIGDLQGYGYCNSDLRANLAAITILQEYYPERLGKLFIVHAPYIFMTMWKIIYPFIDKKTRKKVVFVEDKRLHETLLEDIDKSQLPEIYGGKLQLVPIQNA

XP_057791434.1
MMKTKRRSFSLCEPTPPASLTWQDVDEPTLRRFLRARDLDVEKASAMLVKCLTWRRTFVPKGFVSESEVPNEIAQNKMFLQGTDKKGHPISVVFGSRHFSRKGGLDEFRRFLVFALDKLCQRIPDEVEKFTIIGDLQGYGYCNSDLRANLAAITILQEYYPERLGKLFIVHAPYIFMTMWKIIYPFIDKKTRKKVVFVEDKRLHETLLEDIDKSQLPEIYGGKLQLVPIQNA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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