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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004546`

染色体: Chr02 坐标: 68015368-68019629 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004546`
名称	SmilChr02G004546
描述	probable beta-1,4-xylosyltransferase IRX10L
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68015368 - 68019629 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008539`
GeneID	`131008539`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008539`
原始查询	`SmilChr02G004546`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable beta-1,4-xylosyltransferase IRX10L
产物	probable beta-1%2C4-xylosyltransferase IRX10L
Arabidopsis	`AT5G61840` (GUT1) Exostosin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836306] identity=87.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0926700` (OsIRX10) - identity=84.7; qcov=0.971; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006486 (GO:0006486); GO:0009834 (plant-type secondary cell wall biogenesis); GO:0010417 (glucuronoxylan biosynthetic process); GO:0047517 (1,4-beta-D-xylan synthase activity); GO:0080116 (glucuronoxylan glucuronosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03016 (Exostosin_GT47)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008539

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057791431.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057791431.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791431.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791431.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791431.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68017918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr2:68017971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr2:68018145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr2:68018166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:68018393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C60,D4
`Chr2:68018516`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B12,B30,C57
`Chr2:68018528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:68018539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr2:68018910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B84,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791431.1

416 aa

208

416

Exostosin_GT47

PF03016 Exostosin_GT47 49-344 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791431.1`	Pfam	`PF03016`	Exostosin_GT47	Domain	49	344	2.2e-74	251.1	Exostosin GT47 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935448.1
CTGACGCGATTCGCACCGAGTCACCGGGCAGCGTTATTGTGTGAGTCTAGTCCGAGTTGACTCAACACCATTCGAGCCGACCAAATTGTTTTGAGTTGCAGAATTATAATTGTAGATCACATTTCTAAATTCTAACCAACCCAGATCAATAGATCATACCAATCTCTTCCTCCCTCAAAGTAATTCATTTCTACTTGCGCCAAAATTTTCATAATCACTTACCTTTTATTCTCTCTTAAGATCCTAAGAAAACTGCTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008539
ATGAGGAACCGGAGATGGGTATTCGCTTTGCTTCTTTGTTTTTCAACTTTTTGGAGGATTGAAGCTTTCAAGTTCCACAGAGCTCAGAAAACTGAGAGAATCTCCGGGAGCGCGGGTGATGTCCTGGAAGATGATCCTGTCGGAAGGTTAAAGGTTTTCGTTTATGAGCTTCCTAGCAAATACAACAAAAAGATTTTACAGAAGGACCCAAGATGCCTCACCCATATGTTTGCAGCGGAGATTTTCATGCACCGTTTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791431.1
MRNRRWVFALLLCFSTFWRIEAFKFHRAQKTERISGSAGDVLEDDPVGRLKVFVYELPSKYNKKILQKDPRCLTHMFAAEIFMHRFLLSSPVRTLNPEEADWFYTPVYTTCDLTPNGLPLPFKSPRMMRSAIQLISSNWPYWNATEGADHFFIVPHDFGACFHYLEEKAIERGILPLLQRATLVQTFGQRNHVCLKGGSIIIPPYAPPQKMQAHLISPSTPRSIFVYFRGLFYDVGNDPEGGYYARGARASVWENFKDNP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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