当前解析结果
SmilChr02G004549| 统一新 Gene ID | SmilChr02G004549 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G004549 |
| 描述 | uncharacterized protein At4g14100-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 68031027 - 68033650 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008543 |
|---|---|
| GeneID | 131008543 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008543 |
| 原始查询 | SmilChr02G004549 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | transferring glycosyl group transferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821958]; symbol=AT3G23760; hit=AT3G23760; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | transferring glycosyl group transferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821958]; symbol=AT3G23760; hit=AT3G23760; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT3G23760 (AT3G23760)transferring glycosyl group transferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821958] identity=59.2; qcov=0.925; evalue=6.88e-75; confidence=high |
| Rice | Os07g0189800- identity=58.3; qcov=0.724; evalue=1.92e-56; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF28435 (DUF8395) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008543 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Lysosome | 溶酶体 | 0.80000 | XP_057791437.1 |
| 2 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.60000 | XP_057791437.1 |
| 3 | Cytoplasmic vesicle | 细胞质囊泡 | 0.40000 | XP_057791437.1 |
| 4 | Vesicle | 囊泡 | 0.40000 | XP_057791437.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057791437.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:68033156 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C22 |
Chr2:68033457 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B114,B12,B30,C57 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057791437.1PF28435
DUF8395 29-175 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057791437.1 |
Pfam | PF28435 |
DUF8395 | Domain | 29 | 175 | 9.7e-73 | 243.8 | Domain of unknown function (DUF8395) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。