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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004558`

染色体: Chr02 坐标: 68103579-68107567 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004558`
名称	SmilChr02G004558
描述	sucrose nonfermenting 4-like protein
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68103579 - 68107567 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008552`
GeneID	`131008552`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008552`
原始查询	`SmilChr02G004558`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sucrose nonfermenting 4-like protein
产物	sucrose nonfermenting 4-like protein
Arabidopsis	`AT1G09020` (SNF4) sucrose nonfermenting-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837423] identity=42.5; qcov=1.06; evalue=4.81e-127; confidence=medium
Rice	`Os03g0856400` (OsCBSX8) - identity=41.3; qcov=1.1; evalue=2.26e-121; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00571 (CBS); PF16561 (AMPK1_CBM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008552

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791446.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057791446.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057791446.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791446.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791446.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68103773`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B33,C8,C85
`Chr2:68103889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr2:68104053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr2:68104470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B20,C44
`Chr2:68106194`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B84
`Chr2:68106194`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B84
`Chr2:68106224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C60,D4
`Chr2:68107205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791446.1

441 aa

220

441

AMPK1_CBM

CBS

PF16561 AMPK1_CBM 3-87 aa PF00571 CBS 134-182 aa PF00571 CBS 313-360 aa PF00571 CBS 393-439 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791446.1`	Pfam	`PF16561`	AMPK1_CBM	Family	3	87	4.3e-24	85.2	Glycogen recognition site of AMP-activated protein kinase
`XP_057791446.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	134	182	2.3e-25	89.4	CBS domain
`XP_057791446.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	313	360	2.3e-25	89.4	CBS domain
`XP_057791446.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	393	439	2.3e-25	89.4	CBS domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935463.1
ATCATCATTCCATACTCTTTTTTCTTTTAAAATTCCCCCACACAGTGACACACACCTCCCCTTTTCTTCACTGACAACGACATCAATCCTTAAATATTCCCCTCTTTTTCCATTGCTAAACCTTTGATTTCTCGATGGTCGGAAGATCCAAGAAAACTGGCCCTTTTTTATTTTTCTATCCAGTTATATTGCAAGTTTGTTTATTTTTGGGTTTCAAGGCGGGGGATTTCTCATTTCTCTGTAGTTTAATAATGGCGGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008552
ATGGTGCAAACTCCGTTTACATGGCGCTATGGCGGTCGTCAAGTCTTCCTCTCCGCTTCCTTCAATGGGTGGACTGAGAGGATACCGCTGCTTTTAGTGGAAGGTTCGGAAACTATTTTTCAGAAGATTATTGATCTTCTGCCTGGATGTTATCAGTACAAATTCTTGGTTGATGGTACATGGGAAGTTGATCAGCAGCAGGTTTGTGCTACAGATGAGTTCGGAACTACAAACAACGTAGTTGTCGTGAGTGCAACGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791446.1
MVQTPFTWRYGGRQVFLSASFNGWTERIPLLLVEGSETIFQKIIDLLPGCYQYKFLVDGTWEVDQQQVCATDEFGTTNNVVVVSATSFAGSSSGVPLDGTVVPLTDGEMDISRQVVSMHLLSSTTYELIPISGKVIALDVEVDVEQAFHVMYDLGLTVVPLWDESSGQLAGMLTASDFILILLQLHGDQGMFANEELQARTVSSWKGWKLQHHRDLIRTTVPFQRRPLIHAGPDESLAGLASRILHNNISAVPIIHSVNG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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