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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004560`

染色体: Chr02 坐标: 68121367-68127126 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004560`
名称	SmilChr02G004560
描述	uncharacterized SmilChr02G004560
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68121367 - 68127126 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008554`
GeneID	`131008554`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008554`
原始查询	`SmilChr02G004560`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Amidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830627]; symbol=AT5G07360; hit=AT5G07360; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Amidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830627]; symbol=AT5G07360; hit=AT5G07360; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G07360` (AT5G07360) Amidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830627] identity=73.7; qcov=0.869; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0536800` - identity=74.1; qcov=0.841; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003824 (catalytic activity)
KEGG	-
Pfam	PF01425 (Amidase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008554

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057791449.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057791449.1`
3	Lysosome	溶酶体	0.20000	`XP_057791449.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791449.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791449.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68121792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr2:68121800`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B126,B129,C4,C75,D1
`Chr2:68121800`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B126,B129,C4,C75,D1
`Chr2:68121825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,C8,C85
`Chr2:68122131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B30,C29,C57,C6
`Chr2:68122206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr2:68122245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B48,B89,C40
`Chr2:68122289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr2:68123780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr2:68124081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,C80,C81
`Chr2:68124087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C29
`Chr2:68124333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791449.1

634 aa

317

634

Amidase

PF01425 Amidase 196-461 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791449.1`	Pfam	`PF01425`	Amidase	Domain	196	461	2.6e-58	198.9	Amidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935466.1
CCCTCTGCCGGGTGGGGCCCACCGTCGGGAAACGAAACTTTTTTTTTCTTTTTTAAGTAAAATTGATAGAATTAGCAGCGGTACTGTACAGGCCGAAAATGCAGAAAGAAAAGCGGCATCAATCACAGGCCATGACCATGAGCTTCGCTGTGTCAGCCGGCACGTGTCTCACTGCACCTGCCCTCCGCCCGACACGTATTTGCTGGTGCCTATGCCTCCTTGTCCTCGCCGCCATTGCTGTCGCCGCTGCCGCTTCATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008554
ATGCAGAAAGAAAAGCGGCATCAATCACAGGCCATGACCATGAGCTTCGCTGTGTCAGCCGGCACGTGTCTCACTGCACCTGCCCTCCGCCCGACACGTATTTGCTGGTGCCTATGCCTCCTTGTCCTCGCCGCCATTGCTGTCGCCGCTGCCGCTTCATTTCCAAATGATCAGATCGCGATTCTTGCGTCCCTCATGGACAGTACGCAAGTGAACTTGAGAAACCATAGTAAATGCACTGGAAAGATGGATCATGATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791449.1
MQKEKRHQSQAMTMSFAVSAGTCLTAPALRPTRICWCLCLLVLAAIAVAAAASFPNDQIAILASLMDSTQVNLRNHSKCTGKMDHDSLCSMFGLLDAEFFSDAKMLEIEKGARELNLPIIKSNRELVASVNGGLENPSCLVFSSSWSHDHAQHASKKFNYPSLSGIERPKSDEDIAFMSIHELGQLIMSKQITSEELARIFLNRLKRYGPVLESVITITEELAYEQARRADQLLAQGKYLGPLHGIPYGLKDIIAVPHYK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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