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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004569`

染色体: Chr02 坐标: 68201051-68206359 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004569`
名称	SmilChr02G004569
描述	protein FRIGIDA
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68201051 - 68206359 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008578`
GeneID	`131008578`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008578`
原始查询	`SmilChr02G004569`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FRIGIDA
产物	protein FRIGIDA
Arabidopsis	`AT4G00650` (FRI) FRIGIDA-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828044] identity=43.6; qcov=0.422; evalue=8.24e-62; confidence=low
Rice	`Os09g0248300` - identity=26.9; qcov=0.502; evalue=1.92e-25; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07899 (Frigida)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008578

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791490.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791490.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791490.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791490.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791490.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68201306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr2:68201451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr2:68201501`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr2:68201520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B61,B62,C58
`Chr2:68201570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr2:68201622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,C48,C55
`Chr2:68202003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B48,B89,C40,C75
`Chr2:68202222`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:68202296`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr2:68205279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:68205520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C48
`Chr2:68205836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791490.1

630 aa

315

630

Frigida

PF07899 Frigida 121-416 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791490.1`	Pfam	`PF07899`	Frigida	Family	121	416	1.8e-88	297.3	Frigida-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935507.1
ATTTGGTTTTGCCTATGCGGCTATTAGATATGGCTCTACGGCTCTACTCAACCAGCCCTAATTAATTTGTAAAAAATAGTACTCCTACTAGTTAATTACGAATTACTACAAAAACAACAAAGTAATTCTCAAAATGGCAAACGGCAGCCAAAAATTAATTTAGGGATTTGTTAATTTCGTTCCGGCGACAAGACAACTACCCCCATGGCCGCCACCGTTACACCGCCTCCCAACATGACGGAGGCCAACACCTACGCTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008578
ATGGCCGCCACCGTTACACCGCCTCCCAACATGACGGAGGCCAACACCTACGCTGTCCCTGCAACACCGCCGGCCAATCAGCTGTCTGGCTCCCATCCTCACTCCCCAAAACTCGAAACCCTTTCGCCACGCTCGCCATCGCCGCCGCTCTTCTTGAATTCAATTGCCGAACTCAAAGACTTCTCCTCCGCCATGTCGGGCTTCCTCCATTGCTACGACGACCTCCACAACCACCTCGAATCCATCAAAGGCGCTATTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791490.1
MAATVTPPPNMTEANTYAVPATPPANQLSGSHPHSPKLETLSPRSPSPPLFLNSIAELKDFSSAMSGFLHCYDDLHNHLESIKGAILAMLPPEIPHISQPSPQKPEALEETAMEKQQDDKSPSKSELEGLCKAMCSRGVRKYLASHLSSLPMLQEEVPKALRQAPNPWKLVLECLGKFFLQGSKAFTRNSPMIPAREASILVLECFLLMMGLEVSSENDNRISDIEKAVKEEADVAALAWQKRLMIEGGLARANQVDARG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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