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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004570`

染色体: Chr02 坐标: 68207567-68210095 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004570`
名称	SmilChr02G004570
描述	uncharacterized SmilChr02G004570
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68207567 - 68210095 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008618`
GeneID	`131008618`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008618`
原始查询	`SmilChr02G004570`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome C oxidase assembly factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007681]; symbol=AT1G10865; hit=AT1G10865; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	cytochrome C oxidase assembly factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007681]; symbol=AT1G10865; hit=AT1G10865; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G10865` (AT1G10865) cytochrome C oxidase assembly factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007681] identity=83.1; qcov=1; evalue=1.56e-36; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0033617 (mitochondrial respiratory chain complex IV assembly)
KEGG	-
Pfam	PF10203 (Pet191_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008618

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057791539.1`
2	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	1.00000	`XP_057791539.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791539.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791539.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791539.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68207959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr2:68209616`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	22	B103,B12,B135,B22,B42,B43,B67,B80,B82,B86,B99,C24,C26,C31,C43,C55,C58,C60,C64,C65,C66,C83
`Chr2:68209617`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	22	B103,B12,B135,B22,B42,B43,B67,B80,B82,B86,B99,C24,C26,C31,C43,C55,C58,C60,C64,C65,C66,C83
`Chr2:68209917`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B27,B89,D5
`Chr2:68209923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B27,B89,C82,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791539.1

79 aa

Pet191_N

PF10203 Pet191_N 3-58 aa

XP_057791540.1

71 aa

Pet191_N

PF10203 Pet191_N 3-68 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791539.1`	Pfam	`PF10203`	Pet191_N	Family	3	58	8.3e-17	61.9	Cytochrome c oxidase assembly protein PET191
`XP_057791540.1`	Pfam	`PF10203`	Pet191_N	Family	3	68	7.5e-25	87.7	Cytochrome c oxidase assembly protein PET191

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935557.1
ACCTAAAATCCATTGAACAGATCGAAATGACGGAGCCCAAAGCCCAACCTTTTTTTTTAAAGAATAAAAATCCAAGAATATGATATTAGGAAATAAAGAATTAAAGAACTACAGAAATGGCGAAGTCCTGCAAGGGTCTGGCTACGGAGCTCGTCAAATGCCTCAGCGAATCGGATTGCGTTAAGGTGGAAAACCGGCCATACAGAGAGTGTGCTAAAGAGAAAAGCCCTAATGTTTCGAGTGAGTGTGTGGGACTGAGG...

XM_057935556.1
GAAATGACGGAGCCCAAAGCCCAACCTTTTTTTTTAAAGAATAAAAATCCAAGAATATGATATTAGGAAATAAAGAATTAAAGAACTACAGAAATGGCGAAGTCCTGCAAGGGTCTGGCTACGGAGCTCGTCAAATGCCTCAGCGAATCGGATTGCGTTAAGGTGGAAAACCGGCCATACAGAGAGTGTGCTAAAGAGAAAAGCCCTAATGTTTCGAGTGAGTGTGTGGGACTGAGGGAAACGTATTTCAACTGCAAGAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131008618
ATGGCGAAGTCCTGCAAGGGTCTGGCTACGGAGCTCGTCAAATGCCTCAGCGAATCGGATTGCGTTAAGGTGGAAAACCGGCCATACAGAGAGTGTGCTAAAGAGAAAAGCCCTAATGTTTCGAGTGAGTGTGTGGGACTGAGGGAAACGTATTTCAACTGCAAGAGAGGACAGGTTGATATGAGAGCTCGAATTCGTGGAAACAAGGGTTATTAG

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057791539.1
MAKSCKGLATELVKCLSESDCVKVENRPYRECAKEKSPNVSSECVGLRETYFNCKRGQACIPPLSLSHTFIISVSWFPC

XP_057791540.1
MAKSCKGLATELVKCLSESDCVKVENRPYRECAKEKSPNVSSECVGLRETYFNCKRGQVDMRARIRGNKGY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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