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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004571`

染色体: Chr02 坐标: 68213180-68218239 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004571`
名称	SmilChr02G004571
描述	ACT domain-containing protein ACR11
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68213180 - 68218239 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008600`
GeneID	`131008600`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008600`
原始查询	`SmilChr02G004571`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ACT domain-containing protein ACR11
产物	ACT domain-containing protein ACR11
Arabidopsis	`AT1G16880` (ACR11) uridylyltransferase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838259] identity=75.6; qcov=0.824; evalue=3.1e-128; confidence=high
Rice	`Os12g0152700` - identity=59.6; qcov=0.779; evalue=8.59e-93; confidence=high
GO	GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane); GO:0009570 (chloroplast stroma)
KEGG	-
Pfam	PF22754 (bHLH-TF_ACT-like_plant)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008600

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057791515.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057791515.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791515.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791515.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791515.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68213823`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,C1,C22,C38,C70
`Chr2:68215568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C29
`Chr2:68217742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr2:68217780`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A23
`Chr2:68217780`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791515.1

290 aa

145

290

bHLH-TF_ACT-like_plant

PF22754 bHLH-TF_ACT-like_plant 94-159 aa

XP_057791516.1

289 aa

144

289

bHLH-TF_ACT-like_plant

PF22754 bHLH-TF_ACT-like_plant 94-159 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791515.1`	Pfam	`PF22754`	bHLH-TF_ACT-like_plant	Domain	94	159	3.6e-06	27.7	Plant bHLH transcription factor, ACT-like domain
`XP_057791516.1`	Pfam	`PF22754`	bHLH-TF_ACT-like_plant	Domain	94	159	3.4e-06	27.8	Plant bHLH transcription factor, ACT-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935533.1
AATATCTGAACGAATCAATGATGAGCTTGGACGGTGAAGACAGACTCACGTCTATTTCCAGATAAAAAAAAAAACTCATCTATTCACCCATCTCTCTTGTTTTTCCCAACCTGCAAATTTTCACACAGATTTTTTTCGCACCCGAATGGATAGATTCATTTTCTGAGGCCAAGCTTTTAGCCAGAAAAGAAATGGAAAGAAAACAAGCACGCCCATAAATTCTTTATCTTTTTGCTTCCTCAGAAAAATATTGCAATATT...

XM_057935532.1
GGTGAAGACAGACTCACGTCTATTTCCAGATAAAAAAAAAAACTCATCTATTCACCCATCTCTCTTGTTTTTCCCAACCTGCAAATTTTCACACAGATTTTTTTCGCACCCGAATGGATAGATTCATTTTCTGAGGCCAAGCTTTTAGCCAGAAAAGAAATGGAAAGAAAACAAGCACGCCCATAAATTCTTTATCTTTTTGCTTCCTCAGAAAAATATTGCAATATTCAAATATTATTAAAAAAAATTAAAGTTCACGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131008600
ATGGCTGTAGCTATGGCTTCTAGTTGTAGTAATTTTGGGCTTTACAGCAATTTGAGGGCAATGGAGAAGCAATCTAATCCAAGGGTATCTTCATTTTTGTGCTCTTTTGGGTTGGATCCACTTCAGTTGTCATGCATTAATCCCAAGAAAAGCCTATCGTCTTCCATGAGTACATTTATACCAAAAGCGTCACCATCTACTGCTGTGGAGGGTGGAAGTTCTCAGGAGACAGAAGATGTAGTTCCCACCCCCATCGTAAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057791515.1
MAVAMASSCSNFGLYSNLRAMEKQSNPRVSSFLCSFGLDPLQLSCINPKKSLSSSMSTFIPKASPSTAVEGGSSQETEDVVPTPIVIIDQDSDEDATIVEITFGDRLGALLDTMHALKSLGLNVVKANVYLDASGKHNKFAITKASTGRKVDDPELLEAIRLTIINNLLEYHPESSVQLAMGAAFGVTPPKTIDLDIATHIHVYDDGPEQSLLCVETADRPGLLVDLVKIITDINITVKSGEFDTEVTRGFHTNYFTSVI...

XP_057791516.1
MAVAMASSCSNFGLYSNLRAMEKQSNPRVSSFLCSFGLDPLQLSCINPKKSLSSSMSTFIPKASPSTAVEGGSSQETEDVVPTPIVIIDQDSDEDATIVEITFGDRLGALLDTMHALKSLGLNVVKANVYLDASGKHNKFAITKASTGRKVDDPELLEAIRLTIINNLLEYHPESSVQLAMGAAFGVTPPKTIDLDIATHIHVYDDGPEQSLLCVETADRPGLLVDLVKIITDINITVKSGEFDTEGLLAKAKFHVSYNG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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