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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004575`

染色体: Chr02 坐标: 68251037-68253803 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004575`
名称	SmilChr02G004575
描述	uncharacterized SmilChr02G004575
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68251037 - 68253803 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008589`
GeneID	`131008589`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008589`
原始查询	`SmilChr02G004575`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcriptional regulator of RNA polII, SAGA, subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816989]; symbol=AT2G24530; hit=AT2G24530; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	transcriptional regulator of RNA polII, SAGA, subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816989]; symbol=AT2G24530; hit=AT2G24530; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G24530` (AT2G24530) transcriptional regulator of RNA polII, SAGA, subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816989] identity=41.4; qcov=1.03; evalue=2.35e-92; confidence=medium
Rice	`Os04g0658100` - identity=36.6; qcov=1; evalue=9.49e-71; confidence=medium
GO	GO:0000124 (SAGA complex); GO:0003713 (transcription coactivator activity); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	PF12767 (SAGA-Tad1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008589

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791503.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791503.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791503.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791503.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791503.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68252072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57
`Chr2:68252086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,D6
`Chr2:68252212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr2:68252308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr2:68252309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr2:68252408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B37,D6
`Chr2:68252511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B37,D6
`Chr2:68252633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B32,B63
`Chr2:68252635`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:68252709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr2:68253045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr2:68253046`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791503.1

425 aa

212

425

SAGA-Tad1

PF12767 SAGA-Tad1 5-328 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791503.1`	Pfam	`PF12767`	SAGA-Tad1	Family	5	328	6.5e-57	193.8	Transcriptional regulator of RNA polII, SAGA, subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935520.1
AACTCTTCAGCACGGAGTATCACATATTGAGGTCATACTCTGTGCCTAAATTGTTGTACTCTTGAATAAAATTAGACAAAATAATTTACTTTCTAATCAAATAGGATACGAGAAAGAGAGGAGAGAGAGAGAGCGAGGAGAGAAGCGGAGCGCGATCAGAGAGAAAAACAAAGAAAAGGGGTCTTCAAATTTTTGATTCAGGAAATTTTCTGTGGGGAAGATAAAGATAGTGAAATAGAAATGTGAAGCAAAGATTTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008589
ATGCAACCGCCTCATCAGCGTTCGCGGATCAATCTTGATGAGTTGAGAGCTCAGATAGTAAAGAAACTTGGGCCTGAAGGGTCCAAGCAGTACTTTTACTACTTACAGAGATTCTTGAATTTGAAACTGAGTAAGGTTGAGTTCAACAAACTATGTCTGAGAGTTCTTGGACGGGAGAATATTCCGCTCCACAACCAGCTTATTCGTTCGATACTTAGAAATGCTTGTTGTGCAAAGTCCCCACCTCCGGCATGTCATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791503.1
MQPPHQRSRINLDELRAQIVKKLGPEGSKQYFYYLQRFLNLKLSKVEFNKLCLRVLGRENIPLHNQLIRSILRNACCAKSPPPACHKDDASKHGMHVGSQEICSDGYQQNGSHIGTAQASSSPGLSNGGDMLPVSPKKTRSCFRDRRTGDRRSALGPNGKTSFPPQVAAAAQPIMENGDLNPPDTGMLVQRAEDERENLASHHAKMLTVRRSPDDLAGVYSKEQMQLVGRHDRKEASSRSPLQAPLGVPLCTVSIGGACR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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