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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004577`

染色体: Chr02 坐标: 68262909-68272759 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004577`
名称	SmilChr02G004577
描述	ribulose bisphosphate carboxylase/oxygenase activase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68262909 - 68272759 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008619`
GeneID	`131008619`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008619`
原始查询	`SmilChr02G004577`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ribulose bisphosphate carboxylase/oxygenase activase, chloroplastic
产物	ribulose bisphosphate carboxylase/oxygenase activase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G73110` (AT1G73110) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843642] identity=76.3; qcov=0.941; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0658300` - identity=76.8; qcov=0.871; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	-
Pfam	PF00004 (AAA); PF21228 (RuBisCO_activase_AAA_helical)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008619

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057791541.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057791541.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057791541.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791541.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791541.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68268760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr2:68269615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B106,C29,C74,D10
`Chr2:68270513`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B10,B101
`Chr2:68272331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:68272380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:68272435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791541.1

426 aa

213

426

AAA

RuBisCO_activase_AAA_helical

PF00004 AAA 160-304 aa PF21228 RuBisCO_activase_AAA_helical 307-405 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791541.1`	Pfam	`PF00004`	AAA	Domain	160	304	1.6e-13	52.0	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
`XP_057791541.1`	Pfam	`PF21228`	RuBisCO_activase_AAA_helical	Domain	307	405	3e-33	114.7	Ribulose bisphosphate carboxylase/oxygenase activase, AAA, helical

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935558.1
AACGTTAACGGCCAAAACTGAATTATGAATTTGTGGAGTCCAATTTTAGAGGCCCAAAAGTTGTAGCCATAATCCAAAAAAAGAAAATAGAAAAATAAAAATAAACCCCAAACCTCCACGGCATGGCTCTCTGCTTCCAAATCTCCCCTTCTTCAGTCAAATCCCAATTCTTGTCTAATCCCTTCAATCCCAAATTCTACACCAAAAAACCCTCCAATTTTGTCACAATTTGCTGCAGCCAAAGTGAAGGGGTTGAGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008619
ATGGCTCTCTGCTTCCAAATCTCCCCTTCTTCAGTCAAATCCCAATTCTTGTCTAATCCCTTCAATCCCAAATTCTACACCAAAAAACCCTCCAATTTTGTCACAATTTGCTGCAGCCAAAGTGAAGGGGTTGAGAATGCAACGAGCAAACAGCAAAAGAAGCTGTCCGAACAGTCTTCATGGGAAGCTGAGGATTCTGAAGGCAAAGATTATCTGTACAGGCTTGGAGCAGAGGCCGACAACATGAACATCGCAGTCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791541.1
MALCFQISPSSVKSQFLSNPFNPKFYTKKPSNFVTICCSQSEGVENATSKQQKKLSEQSSWEAEDSEGKDYLYRLGAEADNMNIAVGARAGIIDDLFTGNFLGKDSDIVFDYRQKATRSFEYLQGDYYIAPVFMDKVVVHMAKNFMANLLNVRIPLILGIWGGKGQGKTFQTELIFRALGVEPIIMSAGELESERAGEPGRLIRERYRTASQVVQNQGKMSCLMINDIDAGLGIFGNTQMTVNNQIVVGSLMNIADNPTR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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