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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004585`

染色体: Chr02 坐标: 68343762-68346106 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004585`
名称	SmilChr02G004585
描述	tubby-like protein 8
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68343762 - 68346106 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008593`
GeneID	`131008593`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008593`
原始查询	`SmilChr02G004585`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tubby-like protein 8
产物	tubby-like protein 8
Arabidopsis	`AT1G16070` (TLP8) tubby like protein 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838177] identity=50.5; qcov=0.99; evalue=1.08e-138; confidence=high
Rice	`Os02g0179400` (OsTLP13) - identity=59.2; qcov=0.448; evalue=1.51e-59; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01167 (Tub)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008593

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057791509.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057791509.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791509.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791509.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791509.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68344285`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr2:68344709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C8
`Chr2:68344772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:68344941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr2:68344957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B43,B48,B89,C40,C75
`Chr2:68345056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C29
`Chr2:68345250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr2:68345306`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B1,B11,C23,C85,D8
`Chr2:68345306`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B1,B11,C23,C85,D8
`Chr2:68345310`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B1,B11,C23,C85,D8
`Chr2:68345310`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B1,B11,C23,C85,D8
`Chr2:68345792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791509.1

400 aa

200

400

Tub

PF01167 Tub 148-394 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791509.1`	Pfam	`PF01167`	Tub	Domain	148	394	2.6e-46	159.1	Tub family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935526.1
ATGCACGCCAACTAAATTCATTAAAATTGGCGCTGGTTATCACGCAAAACACTTTCCAAATTCAAAATTTCAAATTCAAAAGTAGCCGTTGCCTCATTATTAGCATCAAGCACAAGACAAAAAAGCAGCATATCCAACCCAACTTCATATTCAACCCCACAAACCCAACCCAAAACGTAGGCTTCGTCGAAATCCATGGCCGGTTGCATGAAAACCTCGATCTCGCTCCAGAATTCCTACACTTCGCTCTACCGCAATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008593
ATGGCCGGTTGCATGAAAACCTCGATCTCGCTCCAGAATTCCTACACTTCGCTCTACCGCAATCCCCTCATGGAGCAGAAAAACTCCAACGAAGGCGCCGGCAATGCCGTTCCTCAAATACGCCGCAACTTAGCCGCAGCCACCGATGACAAAGAGAACTCTTCACCAAACGTCACCGTTAAAACGGATAGCAATGGTCGGAAATATGCAGCTGACATCTTGAAAGAATTCCCGAGTGCCAAGTCCCAAATGAGAGAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791509.1
MAGCMKTSISLQNSYTSLYRNPLMEQKNSNEGAGNAVPQIRRNLAAATDDKENSSPNVTVKTDSNGRKYAADILKEFPSAKSQMRENLLKPSSLELCIKKHEPDSNVGLRVWESLDSGRSNSANVWDYSDSESAPVSSWSTLPNRALLCRPLPVDVGRCTCIIVKESSPDGFDGGTLYTLYTNEGKGRQNRKLAVAHHRRRRGRSEFVVAQSARGIVAPSEDSLIGVVTSNILGSKYHIWDQGHYSNSLTKHPKLLAAVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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