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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004591`

染色体: Chr02 坐标: 68405219-68419360 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004591`
名称	SmilChr02G004591
描述	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog C-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68405219 - 68419360 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008586`
GeneID	`131008586`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008586`
原始查询	`SmilChr02G004591`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog C-like
产物	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog C-like
Arabidopsis	`AT4G31880` (AT4G31880) transcriptional regulator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829318] identity=52.3; qcov=0.129; evalue=1.15e-16; confidence=weak
Rice	`Os04g0501600` (BIP106) - identity=49.2; qcov=0.125; evalue=2.96e-14; confidence=weak
GO	GO:0000785 (chromatin); GO:0005634 (nucleus); GO:0006281 (DNA repair); GO:0007064 (mitotic sister chromatid cohesion)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008586

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791500.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057791500.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057791500.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791500.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791500.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68407382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:68412406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:68412407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B110,C16,C21
`Chr2:68412595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B97
`Chr2:68413302`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,C32,C68
`Chr2:68413349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:68413367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B94
`Chr2:68414699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,C72
`Chr2:68415149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,C72
`Chr2:68415155`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A14,B16,C43
`Chr2:68415155`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A14,B16,C43
`Chr2:68416060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,B61,B62

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935517.1
CTATTGTTTCTGAAGTACTTGAAAGATGATATCGTGAGCCACTCTGAAAAAGGGCAAGGGTCTCGGACAAAAGTATACTCTGTGAAGAAAGGCAAGAGAAAGACTACTGCTTCTGAAGACCTAAAAGAAGATATCATGAGCCGTTCTGAAAAAGAGCAAGGGTCTGGGATGAAGGCTGTGAAGAAAGGCAGGAAAAAGGCTATTGTTTCTGACGACATAAAAGAAGATATTATGAGCAACTTTGAAGAAGGGCAAGGGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008586
ATGAGCCGTTCTGAAAAAGAGCAAGGGTCTGGGATGAAGGCTGTGAAGAAAGGCAGGAAAAAGGCTATTGTTTCTGACGACATAAAAGAAGATATTATGAGCAACTTTGAAGAAGGGCAAGGGTCTTTAACCAAGGTATCTTCTGTGAACAAAGGCAGGAGAAACACTATCGTTTCTGAAGACCAAAAAGAAGATATCATTAGCTGCTCTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGGCAAGGGTCTTTGATAAAGGTATCTTCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791500.1
MSRSEKEQGSGMKAVKKGRKKAIVSDDIKEDIMSNFEEGQGSLTKVSSVNKGRRNTIVSEDQKEDIISCSEEEEEEGQGSLIKVSSVKKGRRKTIVSKDSKADTLSSSEEEGQGSLPKVSSVKKGSRRKTIISDDLREDIVGHSKEGQGSGIKVYSVKKGKRKTIVSEDLKEDIMNNCEEGQGSMKKSTSEEEGQESLTKVSSVKKGRRKTIVSKDSKQDTVSRSGKGQGSGNKVSSVMKRKGKAIVSEDLKEDIMSSSE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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