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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004597`

染色体: Chr02 坐标: 68488056-68493326 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004597`
名称	SmilChr02G004597
描述	DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68488056 - 68493326 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008597`
GeneID	`131008597`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008597`
原始查询	`SmilChr02G004597`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease
产物	DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease
Arabidopsis	`AT3G48425` (AT3G48425) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824001] identity=72.2; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0279600` - identity=70; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003906 (DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006284 (base-excision repair); GO:0008081 (phosphoric diester hydrolase activity); GO:0008311 (double-stranded DNA 3'-5' DNA exonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF03372 (Exo_endo_phos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008597

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791512.1`
2	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057791512.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057791512.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791512.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791512.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68488312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C29
`Chr2:68488510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B84
`Chr2:68488650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B41,C72
`Chr2:68491264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr2:68491275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,B44
`Chr2:68491283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B16,C43
`Chr2:68491352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,B84,C44
`Chr2:68492658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:68492769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B28,C61,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791512.1

364 aa

182

364

Exo_endo_phos

PF03372 Exo_endo_phos 53-350 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791512.1`	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	53	350	2.4e-21	77.2	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935529.1
ACAATATAAGAACAAATCATTTAAAATCATAAAAATAAATAATTTGCCCCTTCTTTCTTTATATGTGGCACTGGTTCTTCACTAGTAATTAGTTCTGTCCGTCCTTGATTTCATAATTCGTATATCAAATTTTGTATGTGAATCTCTTCTCATATGATGCGAGTAATTGAGAGTGATAACTGTAGTTAGATTGGTGAAATCAACTACGTTCAATTTCGAATCCTTCCATTTGGTTTATAATAGTGTTTTTTACAAACCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008597
ATGAAGAGATTTTTCAAAGCAGTAGAGAAAGATGGCTCTTTCAAGAAACCAGCTCTCTCCCCTCTCTCTTCACCCGCAAAAGATTCTGAAAAACCAACAGAAAATGCTGCTGCTACTGAGAACAACGAAACTTCAAAGAAAGAGCCTTCGAAATTCTTGACATGGAACGCAAATAGTCTTCTGCTAAGAATCAAGAACAACTGGACAGAGTTCTCCAAATTCGTCGAGAATCTTGACCCGGATGTCATCGCTATACAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791512.1
MKRFFKAVEKDGSFKKPALSPLSSPAKDSEKPTENAAATENNETSKKEPSKFLTWNANSLLLRIKNNWTEFSKFVENLDPDVIAIQEVRMPAAGSKGAPRNPREFKDDTSSSREEKLVVMRALSNAPFRDYNVWWSLSDSKYAGTALFIKKCFNPQKVSFSLDQAGSKHEPDGRVILAEFESFRLLNTYVPNNGWKEEESSFQRRRKWDKRIKEFVFRTSNKPLIWCGDLNVSHEDIDVSHPEFFAAAKLNGYVPPNKED...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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