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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004600`

染色体: Chr02 坐标: 68521059-68526346 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004600`
名称	SmilChr02G004600
描述	auxin response factor 2A-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68521059 - 68526346 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008571`
GeneID	`131008571`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008571`
原始查询	`SmilChr02G004600`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin response factor 2A-like
产物	auxin response factor 2A-like
Arabidopsis	`AT5G62000` (ARF2) auxin response factor 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836321] identity=61.6; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0523800` (OsARF1) - identity=55.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009725 (response to hormone)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02309 (AUX_IAA); PF02362 (B3); PF06507 (ARF_AD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008571

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791481.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791481.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791481.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791481.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791481.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68521562`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B34
`Chr2:68522138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,C45
`Chr2:68522331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:68522437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,C45
`Chr2:68522439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,C45
`Chr2:68522468`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B121,B64,C20,C87
`Chr2:68522529`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B140
`Chr2:68522529`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B140
`Chr2:68522765`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr2:68523141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:68523170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr2:68523829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791481.1

824 aa

412

824

ARF_AD

AUX_IAA

PF02362 B3 144-245 aa PF06507 ARF_AD 293-375 aa PF02309 AUX_IAA 681-788 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791481.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	144	245	9.5e-24	84.0	B3 DNA binding domain
`XP_057791481.1`	Pfam	`PF06507`	ARF_AD	Domain	293	375	1.4e-37	128.2	Auxin response factor ancillary domain
`XP_057791481.1`	Pfam	`PF02309`	AUX_IAA	Family	681	788	3.4e-13	50.6	AUX/IAA family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935498.1
AAAAGGAAAACACGAAAAAGCAGAAAAAGGTTTCCCAAACTAGGCCTAAAGAATTCACCGGGAGTAACCAGTTTCTCCGCTGTCCATCTCTCATTTCTACTGACTCAACCCCCTTCCCCACTCGCCTGGTTATCTCAACTCTCTCGCTCTACTTTCTCTCTCATCACCTATTAGCTCCCACTGCGTGGAGATATCAGATATACTCTACAACGCACCAAAATCGGTTGCAAAATTCTTCCAGGGATTTTCCCCTGTTCTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008571
ATGGCCGCGTCCGAGGCGTCGATCAAGGGTTATAATGATGCCAGCAACTATAATTCCGCCGCCGATAATGGAAACTCCGTCTCCGGCAGCATAGTGGATGCTGAGAAGGCGTTGTACACAGAGCTATGGAAGGCCTGCGCCGGCCCGTTGGTGACCGTACCTTGTGAAAACGATCTCGTCTTCTATTTTCCTCAGGGTCACATAGAACAGGTGGAGGCATCTACTAATCAAAGTGCAGACCAGCAGATGCCTGTGTATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791481.1
MAASEASIKGYNDASNYNSAADNGNSVSGSIVDAEKALYTELWKACAGPLVTVPCENDLVFYFPQGHIEQVEASTNQSADQQMPVYNLPSKILCRVVNVSLKAEPDTDEVFAQVTLLPVPNQDENAVKKEPLPVPPPRFHVHSFCKTLTASDTSTHGGFSVLRRHADECLPPLDMSRQPPTQELVAKDLHGIEWRFRHIFRGQPRRHLLQSGWSVFVSSKRLVAGDAFIFLRGENGELRVGVRRAMRQQGNAPSSVISSH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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