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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004601`

染色体: Chr02 坐标: 68532082-68534809 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004601`
名称	SmilChr02G004601
描述	transcription factor ICE1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68532082 - 68534809 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008588`
GeneID	`131008588`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008588`
原始查询	`SmilChr02G004601`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor ICE1-like
产物	transcription factor ICE1-like
Arabidopsis	`AT3G26744` (ICE1) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822287] identity=50.9; qcov=1; evalue=1.04e-119; confidence=high
Rice	`Os11g0523700` (OsbHLH002) - identity=62.3; qcov=0.639; evalue=6.12e-97; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH); PF22754 (bHLH-TF_ACT-like_plant)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008588

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791502.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791502.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791502.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791502.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791502.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68532344`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B20,C62,C78
`Chr2:68532492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:68532718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr2:68532774`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	136	A10,A11,A15,A19,A2,A20,A21,A23,A24,A25,A3,A5,A6,A7,B102,B106,B108,B11,B111,B112,B115,B117,B118,B124,B125,B126,B128,B131,B132,B134,B136,B137,B14,B140,B16,B17,B18,B2,B20,B23,B26,B30,B32,B39,B4,B42,B43,B48,B5,B52,B55,B56,B59,B6,B60,B61,B64,B68,B69,B7,B72,B73,B74,B76,B77,B8,B80,B81,B82,B84,B85,B88,B89,B9,B91,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C12,C13,C15,C16,C19,C2,C20,C24,C26,C27,C29,C3,C30,C31,C35,C36,C39,C4,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C58,C59,C61,C62,C64,C66,C68,C7,C70,C71,C73,C76,C77,C78,C80,C83,C86,C87,D11,D2,D3,D4,D6,D8
`Chr2:68532796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B23,C25
`Chr2:68532800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr2:68532806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr2:68532810`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	140	A10,A11,A15,A16,A19,A2,A20,A21,A24,A3,A4,A5,A6,A7,B102,B105,B106,B108,B11,B111,B112,B115,B117,B118,B124,B125,B126,B128,B130,B131,B132,B134,B136,B137,B14,B140,B16,B17,B18,B2,B20,B23,B26,B28,B30,B32,B33,B38,B39,B4,B42,B43,B48,B5,B52,B53,B56,B59,B6,B60,B61,B64,B69,B7,B70,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B80,B81,B82,B84,B85,B86,B88,B89,B9,B93,B96,B97,B98,C1,C10,C12,C13,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C24,C26,C27,C29,C3,C30,C31,C35,C36,C39,C4,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C58,C59,C61,C62,C64,C66,C68,C7,C71,C73,C76,C77,C78,C80,C83,C86,C87,D11,D3,D4,D6,D8
`Chr2:68532819`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A11,A3,B84,C12
`Chr2:68532819`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A11,A3,B84,C12
`Chr2:68532880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr2:68533111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791502.1

485 aa

242

485

HLH

bHLH-TF_ACT-like_plant

PF00010 HLH 295-337 aa PF22754 bHLH-TF_ACT-like_plant 402-475 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791502.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	295	337	1e-09	38.8	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057791502.1`	Pfam	`PF22754`	bHLH-TF_ACT-like_plant	Domain	402	475	6.1e-10	39.8	Plant bHLH transcription factor, ACT-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935519.1
ACAAATACGGCAGGTAGACTCAAAACTTAACGTTGGAAGCTTTTAGTATTGTCACATTGCCTCACTCAAACAAACACTCTTCCCTTTTCTCATAAAGCTACTTCCCTTTTTCTTCTGCTACTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGTTATGCATGTAACTGTGTGCTACTAAGTAGAACTAGAACACAGAATTTAGAAGAGGAGATGCTATCAAGAGTGAATAGCATGGTCTGGATGGACGGCACCAAAGGAGACACCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008588
ATGCTATCAAGAGTGAATAGCATGGTCTGGATGGACGGCACCAAAGGAGACACCGACGAGCACACATCTTCCTGGCCCCAAAACGACGACGCCGACAACAACAACAAGGACCAAATGGAAATCGGCGCCCTCTCCACCTTCAAATCCATGCTCGAAGCCGAAAACGAGGACTGGTACATCACCAGCACCGGCGCCACCTCCGCTGCTGCGCCCATGCACGACATCTCATTCTCCCCGACCTTCACCGAAGCCGCCGTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791502.1
MLSRVNSMVWMDGTKGDTDEHTSSWPQNDDADNNNKDQMEIGALSTFKSMLEAENEDWYITSTGATSAAAPMHDISFSPTFTEAAVNNQLLLQPIDSSASCSPTSAFNNNLDAASQVNYFLQPKPLINHPIQNNALDASFDLGCDGGYLESALNRGGGILNCGFPMGNIGFGLGEGSASSLFNRSKILKPLDHNFGSMGSQPTLFQKRAALRKNLGSNLGCLSLDRSQIYESEMKRKGSSGDDVEDLSIDGSSFNYDSDD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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