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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004605`

染色体: Chr02 坐标: 68558800-68560419 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004605`
名称	SmilChr02G004605
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP17-2, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68558800 - 68560419 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008605`
GeneID	`131008605`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008605`
原始查询	`SmilChr02G004605`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP17-2, chloroplastic-like
产物	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP17-2%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G18170` (AT1G18170) FKBP-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838396] identity=56.2; qcov=1.03; evalue=1.93e-91; confidence=high
Rice	`Os03g0708500` (OsFKBP17-2) - identity=70.3; qcov=0.746; evalue=7.26e-88; confidence=high
GO	GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity); GO:0009507 (chloroplast)
KEGG	-
Pfam	PF00254 (FKBP_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008605

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057791521.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057791521.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057791521.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057791521.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791521.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68558937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr2:68558994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,B84,C44
`Chr2:68559036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr2:68559086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C75
`Chr2:68559091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B20,C62,C78
`Chr2:68559152`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,B91
`Chr2:68560113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:68560192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791521.1

248 aa

124

248

FKBP_C

PF00254 FKBP_C 143-240 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791521.1`	Pfam	`PF00254`	FKBP_C	Domain	143	240	4e-18	66.2	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935538.1
TTCCATTATTTCGTTTCGTTTAGTCATAGAAAGGCCATATGTAGGTCATTATAAAGATAAGGTGGGGACATAAATATTTATCATTCATCTCATATCCAAAATTTTATTCTGCTGAGTTTGTGAAAAATGGCTTCGTTCTTTTCGTCTCCGTCTCCGCCATTTCTATCACTCCCCAAAACAAGAGCCAACAACTACTATACAACTTCTCAATCGCCATCTCCGCCGCAATCTAACCCGCCTCCAAAGCCACCAACTCAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008605
ATGGCTTCGTTCTTTTCGTCTCCGTCTCCGCCATTTCTATCACTCCCCAAAACAAGAGCCAACAACTACTATACAACTTCTCAATCGCCATCTCCGCCGCAATCTAACCCGCCTCCAAAGCCACCAACTCAGCACCTCAGTTCAAACTCAGTAGAGCCGCCGCCGCCTTCTGCCGCCGAGCAAAGGCCTGCGCCCAGAACTGCTGCAGACTCCACTGACTGGATTGCTTCCACCTTGACGAGGCGGTTCGGCATCGGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791521.1
MASFFSSPSPPFLSLPKTRANNYYTTSQSPSPPQSNPPPKPPTQHLSSNSVEPPPPSAAEQRPAPRTAADSTDWIASTLTRRFGIGAGLAWVAFLAVGVVSEQIKTRLEVSREEATTRDVEKEEEVVLRNGIRYYELRVGGGSSPRTGDLVVMNVKGSVQGSGEVFVDTFKSRAIALVLGSRPYGGGICEGLEYALRDMKAGGKRRVIVPPNLGFGEGGADLGEALQIPPSATLEYVVELQKVSIAPA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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